Protein–RNA interactions for Protein: B1AUH1

Ptpru, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, mousemouse

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpruB1AUH1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PtpruB1AUH1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PtpruB1AUH1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PtpruB1AUH1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PtpruB1AUH1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PtpruB1AUH1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PtpruB1AUH1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PtpruB1AUH1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PtpruB1AUH1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PtpruB1AUH1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PtpruB1AUH1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PtpruB1AUH1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PtpruB1AUH1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PtpruB1AUH1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PtpruB1AUH1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PtpruB1AUH1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PtpruB1AUH1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PtpruB1AUH1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PtpruB1AUH1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PtpruB1AUH1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PtpruB1AUH1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PtpruB1AUH1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PtpruB1AUH1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PtpruB1AUH1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PtpruB1AUH1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PtpruB1AUH1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PtpruB1AUH1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PtpruB1AUH1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PtpruB1AUH1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PtpruB1AUH1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PtpruB1AUH1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PtpruB1AUH1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PtpruB1AUH1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PtpruB1AUH1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PtpruB1AUH1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PtpruB1AUH1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PtpruB1AUH1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PtpruB1AUH1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PtpruB1AUH1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PtpruB1AUH1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PtpruB1AUH1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PtpruB1AUH1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PtpruB1AUH1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PtpruB1AUH1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PtpruB1AUH1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PtpruB1AUH1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PtpruB1AUH1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PtpruB1AUH1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PtpruB1AUH1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PtpruB1AUH1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PtpruB1AUH1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PtpruB1AUH1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PtpruB1AUH1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PtpruB1AUH1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PtpruB1AUH1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PtpruB1AUH1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PtpruB1AUH1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PtpruB1AUH1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PtpruB1AUH1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PtpruB1AUH1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PtpruB1AUH1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PtpruB1AUH1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PtpruB1AUH1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PtpruB1AUH1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PtpruB1AUH1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PtpruB1AUH1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PtpruB1AUH1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PtpruB1AUH1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PtpruB1AUH1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PtpruB1AUH1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PtpruB1AUH1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PtpruB1AUH1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PtpruB1AUH1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PtpruB1AUH1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PtpruB1AUH1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PtpruB1AUH1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PtpruB1AUH1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PtpruB1AUH1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PtpruB1AUH1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PtpruB1AUH1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PtpruB1AUH1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PtpruB1AUH1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PtpruB1AUH1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PtpruB1AUH1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PtpruB1AUH1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PtpruB1AUH1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PtpruB1AUH1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PtpruB1AUH1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PtpruB1AUH1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PtpruB1AUH1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PtpruB1AUH1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PtpruB1AUH1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PtpruB1AUH1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PtpruB1AUH1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PtpruB1AUH1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PtpruB1AUH1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PtpruB1AUH1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PtpruB1AUH1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PtpruB1AUH1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PtpruB1AUH1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms