Protein–RNA interactions for Protein: A6NAS3

Gm3173, Alpha6-takusan, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3173A6NAS3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3173A6NAS3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3173A6NAS3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3173A6NAS3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3173A6NAS3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3173A6NAS3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3173A6NAS3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3173A6NAS3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3173A6NAS3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3173A6NAS3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3173A6NAS3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3173A6NAS3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3173A6NAS3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3173A6NAS3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3173A6NAS3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3173A6NAS3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3173A6NAS3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3173A6NAS3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3173A6NAS3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3173A6NAS3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3173A6NAS3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3173A6NAS3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3173A6NAS3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3173A6NAS3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3173A6NAS3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3173A6NAS3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3173A6NAS3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3173A6NAS3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gm3173A6NAS3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gm3173A6NAS3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gm3173A6NAS3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gm3173A6NAS3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm3173A6NAS3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm3173A6NAS3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm3173A6NAS3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm3173A6NAS3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm3173A6NAS3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm3173A6NAS3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm3173A6NAS3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm3173A6NAS3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm3173A6NAS3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm3173A6NAS3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm3173A6NAS3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm3173A6NAS3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm3173A6NAS3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm3173A6NAS3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3173A6NAS3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3173A6NAS3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3173A6NAS3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3173A6NAS3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3173A6NAS3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3173A6NAS3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3173A6NAS3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3173A6NAS3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3173A6NAS3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3173A6NAS3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3173A6NAS3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3173A6NAS3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3173A6NAS3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3173A6NAS3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3173A6NAS3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3173A6NAS3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3173A6NAS3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3173A6NAS3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3173A6NAS3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3173A6NAS3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3173A6NAS3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3173A6NAS3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3173A6NAS3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3173A6NAS3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3173A6NAS3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3173A6NAS3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3173A6NAS3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3173A6NAS3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3173A6NAS3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3173A6NAS3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3173A6NAS3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3173A6NAS3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3173A6NAS3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3173A6NAS3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3173A6NAS3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3173A6NAS3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3173A6NAS3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm3173A6NAS3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm3173A6NAS3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm3173A6NAS3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm3173A6NAS3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm3173A6NAS3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm3173A6NAS3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm3173A6NAS3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm3173A6NAS3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm3173A6NAS3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm3173A6NAS3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm3173A6NAS3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm3173A6NAS3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm3173A6NAS3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm3173A6NAS3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm3173A6NAS3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm3173A6NAS3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm3173A6NAS3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.3 ms