Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F6

Ttll13, Tubulin polyglutamylase TTLL13, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll13A4Q9F6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ttll13A4Q9F6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Ttll13A4Q9F6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Ttll13A4Q9F6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Ttll13A4Q9F6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Ttll13A4Q9F6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ttll13A4Q9F6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ttll13A4Q9F6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ttll13A4Q9F6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Ttll13A4Q9F6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ttll13A4Q9F6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Ttll13A4Q9F6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ttll13A4Q9F6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ttll13A4Q9F6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ttll13A4Q9F6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ttll13A4Q9F6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Ttll13A4Q9F6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Ttll13A4Q9F6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ttll13A4Q9F6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ttll13A4Q9F6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Ttll13A4Q9F6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ttll13A4Q9F6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Ttll13A4Q9F6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ttll13A4Q9F6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ttll13A4Q9F6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Ttll13A4Q9F6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ttll13A4Q9F6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Ttll13A4Q9F6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Ttll13A4Q9F6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ttll13A4Q9F6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ttll13A4Q9F6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ttll13A4Q9F6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Ttll13A4Q9F6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ttll13A4Q9F6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ttll13A4Q9F6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Ttll13A4Q9F6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ttll13A4Q9F6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ttll13A4Q9F6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Ttll13A4Q9F6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ttll13A4Q9F6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ttll13A4Q9F6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ttll13A4Q9F6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ttll13A4Q9F6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ttll13A4Q9F6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Ttll13A4Q9F6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ttll13A4Q9F6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ttll13A4Q9F6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ttll13A4Q9F6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ttll13A4Q9F6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ttll13A4Q9F6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ttll13A4Q9F6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ttll13A4Q9F6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ttll13A4Q9F6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ttll13A4Q9F6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ttll13A4Q9F6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Ttll13A4Q9F6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Ttll13A4Q9F6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ttll13A4Q9F6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ttll13A4Q9F6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ttll13A4Q9F6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ttll13A4Q9F6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ttll13A4Q9F6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Ttll13A4Q9F6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ttll13A4Q9F6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ttll13A4Q9F6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Ttll13A4Q9F6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ttll13A4Q9F6 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Ttll13A4Q9F6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ttll13A4Q9F6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ttll13A4Q9F6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ttll13A4Q9F6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ttll13A4Q9F6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ttll13A4Q9F6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ttll13A4Q9F6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ttll13A4Q9F6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ttll13A4Q9F6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ttll13A4Q9F6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ttll13A4Q9F6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ttll13A4Q9F6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ttll13A4Q9F6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ttll13A4Q9F6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ttll13A4Q9F6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ttll13A4Q9F6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ttll13A4Q9F6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ttll13A4Q9F6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Ttll13A4Q9F6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ttll13A4Q9F6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ttll13A4Q9F6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ttll13A4Q9F6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ttll13A4Q9F6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ttll13A4Q9F6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ttll13A4Q9F6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ttll13A4Q9F6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ttll13A4Q9F6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ttll13A4Q9F6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ttll13A4Q9F6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Ttll13A4Q9F6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ttll13A4Q9F6 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ttll13A4Q9F6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ttll13A4Q9F6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms