Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samt1A2BED8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samt1A2BED8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samt1A2BED8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samt1A2BED8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samt1A2BED8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samt1A2BED8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms