Protein–RNA interactions for Protein: A2ARA8

Itga8, Integrin alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,062 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga8A2ARA8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Itga8A2ARA8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Itga8A2ARA8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Itga8A2ARA8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Itga8A2ARA8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Itga8A2ARA8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Itga8A2ARA8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Itga8A2ARA8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Itga8A2ARA8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Itga8A2ARA8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Itga8A2ARA8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Itga8A2ARA8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Itga8A2ARA8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Itga8A2ARA8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Itga8A2ARA8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Itga8A2ARA8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Itga8A2ARA8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Itga8A2ARA8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Itga8A2ARA8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Itga8A2ARA8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Itga8A2ARA8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Itga8A2ARA8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Itga8A2ARA8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Itga8A2ARA8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Itga8A2ARA8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Itga8A2ARA8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Itga8A2ARA8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Itga8A2ARA8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Itga8A2ARA8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Itga8A2ARA8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Itga8A2ARA8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Itga8A2ARA8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Itga8A2ARA8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Itga8A2ARA8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Itga8A2ARA8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Itga8A2ARA8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Itga8A2ARA8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Itga8A2ARA8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Itga8A2ARA8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Itga8A2ARA8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Itga8A2ARA8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Itga8A2ARA8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Itga8A2ARA8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Itga8A2ARA8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Itga8A2ARA8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Itga8A2ARA8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Itga8A2ARA8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Itga8A2ARA8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Itga8A2ARA8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Itga8A2ARA8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Itga8A2ARA8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Itga8A2ARA8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Itga8A2ARA8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Itga8A2ARA8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Itga8A2ARA8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Itga8A2ARA8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Itga8A2ARA8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Itga8A2ARA8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Itga8A2ARA8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Itga8A2ARA8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Itga8A2ARA8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Itga8A2ARA8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Itga8A2ARA8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Itga8A2ARA8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Itga8A2ARA8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Itga8A2ARA8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Itga8A2ARA8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Itga8A2ARA8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Itga8A2ARA8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Itga8A2ARA8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Itga8A2ARA8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Itga8A2ARA8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Itga8A2ARA8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Itga8A2ARA8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Itga8A2ARA8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Itga8A2ARA8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Itga8A2ARA8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Itga8A2ARA8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Itga8A2ARA8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Itga8A2ARA8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Itga8A2ARA8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Itga8A2ARA8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Itga8A2ARA8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Itga8A2ARA8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Itga8A2ARA8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Itga8A2ARA8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Itga8A2ARA8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Itga8A2ARA8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Itga8A2ARA8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itga8A2ARA8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itga8A2ARA8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itga8A2ARA8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itga8A2ARA8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itga8A2ARA8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itga8A2ARA8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itga8A2ARA8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itga8A2ARA8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itga8A2ARA8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itga8A2ARA8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Itga8A2ARA8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms