Protein–RNA interactions for Protein: A2AF53

Tmem185a, Transmembrane protein 185A, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem185aA2AF53 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem185aA2AF53 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem185aA2AF53 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem185aA2AF53 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem185aA2AF53 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem185aA2AF53 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem185aA2AF53 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem185aA2AF53 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem185aA2AF53 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem185aA2AF53 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem185aA2AF53 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem185aA2AF53 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem185aA2AF53 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem185aA2AF53 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem185aA2AF53 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem185aA2AF53 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem185aA2AF53 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem185aA2AF53 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem185aA2AF53 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem185aA2AF53 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem185aA2AF53 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem185aA2AF53 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem185aA2AF53 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem185aA2AF53 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem185aA2AF53 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem185aA2AF53 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem185aA2AF53 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem185aA2AF53 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem185aA2AF53 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem185aA2AF53 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem185aA2AF53 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem185aA2AF53 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem185aA2AF53 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem185aA2AF53 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem185aA2AF53 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem185aA2AF53 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem185aA2AF53 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem185aA2AF53 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem185aA2AF53 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem185aA2AF53 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem185aA2AF53 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem185aA2AF53 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem185aA2AF53 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem185aA2AF53 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem185aA2AF53 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem185aA2AF53 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem185aA2AF53 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem185aA2AF53 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem185aA2AF53 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem185aA2AF53 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem185aA2AF53 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem185aA2AF53 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem185aA2AF53 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem185aA2AF53 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem185aA2AF53 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem185aA2AF53 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem185aA2AF53 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem185aA2AF53 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem185aA2AF53 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem185aA2AF53 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem185aA2AF53 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem185aA2AF53 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem185aA2AF53 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem185aA2AF53 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem185aA2AF53 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem185aA2AF53 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem185aA2AF53 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem185aA2AF53 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Tmem185aA2AF53 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Tmem185aA2AF53 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Tmem185aA2AF53 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem185aA2AF53 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem185aA2AF53 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem185aA2AF53 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem185aA2AF53 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem185aA2AF53 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem185aA2AF53 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem185aA2AF53 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem185aA2AF53 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem185aA2AF53 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem185aA2AF53 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem185aA2AF53 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem185aA2AF53 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem185aA2AF53 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem185aA2AF53 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem185aA2AF53 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem185aA2AF53 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem185aA2AF53 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem185aA2AF53 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem185aA2AF53 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem185aA2AF53 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem185aA2AF53 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem185aA2AF53 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem185aA2AF53 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem185aA2AF53 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem185aA2AF53 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem185aA2AF53 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem185aA2AF53 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem185aA2AF53 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem185aA2AF53 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms