Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RPT6

4930433I11Rik, RIKEN cDNA 4930433I11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930433I11RikA0A0U1RPT6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930433I11RikA0A0U1RPT6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930433I11RikA0A0U1RPT6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930433I11RikA0A0U1RPT6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930433I11RikA0A0U1RPT6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
4930433I11RikA0A0U1RPT6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930433I11RikA0A0U1RPT6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930433I11RikA0A0U1RPT6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms