Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H9

Igkv1-132, Immunoglobulin kappa variable 1-132 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Igkv1-132A0A0B4J1H9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Igkv1-132A0A0B4J1H9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Igkv1-132A0A0B4J1H9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Igkv1-132A0A0B4J1H9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Igkv1-132A0A0B4J1H9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Igkv1-132A0A0B4J1H9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Igkv1-132A0A0B4J1H9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Igkv1-132A0A0B4J1H9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms