Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 R3hcc1l-201ENSMUST00000026188 4112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Gm37125-201ENSMUST00000195877 1559 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Cnpy4-202ENSMUST00000110934 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Nobox-201ENSMUST00000031749 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Pla2g2d-201ENSMUST00000030528 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irx2P81066 1600029O15Rik-202ENSMUST00000179787 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Brd9-201ENSMUST00000099384 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Tectb-201ENSMUST00000025936 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irx2P81066 4833412K13Rik-201ENSMUST00000195509 1479 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Tcf23-201ENSMUST00000006818 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Mcm5-203ENSMUST00000212426 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Katnb1-201ENSMUST00000034239 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Bpifb2-201ENSMUST00000028983 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Gm43511-201ENSMUST00000197084 2297 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Tulp4-209ENSMUST00000149756 8784 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Mrps5-201ENSMUST00000028852 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Serping1-202ENSMUST00000111641 1665 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Kcnt1-215ENSMUST00000200434 3609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Tnr-201ENSMUST00000111669 4424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Gm26749-201ENSMUST00000181387 1933 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Ptchd4-201ENSMUST00000048691 6890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Pcdhb20-201ENSMUST00000052179 3559 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Dido1-204ENSMUST00000103055 4613 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Gm28898-201ENSMUST00000189604 2167 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Gm38066-201ENSMUST00000193223 1634 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Sgsh-202ENSMUST00000100172 4223 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Ttll7-201ENSMUST00000037942 7394 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Lrrc57-201ENSMUST00000102496 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Gm5099-201ENSMUST00000194892 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Bcl6b-201ENSMUST00000000326 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Zcchc12-201ENSMUST00000048067 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Npy4r-201ENSMUST00000052164 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Ciao1-201ENSMUST00000003759 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Smgc-204ENSMUST00000109277 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irx2P81066 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irx2P81066 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irx2P81066 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Mrgprx3-ps-201ENSMUST00000187741 918 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Loxhd1-201ENSMUST00000035501 3814 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Acan-201ENSMUST00000032835 7355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irx2P81066 AC133598.5-201ENSMUST00000224937 1517 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Urb1-203ENSMUST00000140920 7344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Rfx2-202ENSMUST00000086801 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Rffl-201ENSMUST00000021036 1719 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Gm45757-201ENSMUST00000211835 1480 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Wdr6-201ENSMUST00000068700 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Arhgap25-203ENSMUST00000113637 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Adcy7-201ENSMUST00000098521 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Echdc3-201ENSMUST00000042658 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Stxbp5l-205ENSMUST00000114782 3996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Olfr95-201ENSMUST00000060728 5129 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Pcdhb4-201ENSMUST00000056712 3718 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Irx2P81066 A530041M06Rik-201ENSMUST00000199690 2288 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Dchs1-201ENSMUST00000078482 10754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Brca2-210ENSMUST00000202313 10517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Gm44937-201ENSMUST00000207705 2691 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Ddb2-202ENSMUST00000111352 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Zfp42-201ENSMUST00000082120 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Trpc7-202ENSMUST00000109871 3519 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Napepld-201ENSMUST00000060899 3724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Ncoa7-210ENSMUST00000217138 2192 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Irx2P81066 4933427I04Rik-201ENSMUST00000097896 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Smarca1-202ENSMUST00000088973 4798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Pot1a-209ENSMUST00000166445 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Irx2P81066 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Irx2P81066 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Irx2P81066 CT009757.1-201ENSMUST00000222801 738 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms