Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Raf1-202ENSMUST00000112949 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q8BGC1 9530026P05Rik-201ENSMUST00000181121 2142 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Gm37975-201ENSMUST00000195494 2099 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Q8BGC1 D3Ertd751e-201ENSMUST00000026867 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Pcdh15-221ENSMUST00000146682 1891 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q8BGC1 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Q8BGC1 5430430B14Rik-201ENSMUST00000209427 1630 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Gm7052-201ENSMUST00000167568 1512 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Q8BGC1 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Gm5543-201ENSMUST00000193329 1091 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Q8BGC1 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q8BGC1 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Q8BGC1 AC157650.1-201ENSMUST00000224582 610 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q8BGC1 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q8BGC1 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q8BGC1 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q8BGC1 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q8BGC1 Ppp2r2a-201ENSMUST00000089230 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q8BGC1 Gm38413-202ENSMUST00000198449 2348 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q8BGC1 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q8BGC1 Alppl2-201ENSMUST00000027455 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q8BGC1 Drc3-201ENSMUST00000070805 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q8BGC1 Ptpn7-201ENSMUST00000049449 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q8BGC1 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q8BGC1 Cpsf3-211ENSMUST00000222968 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q8BGC1 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q8BGC1 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q8BGC1 Rangap1-203ENSMUST00000171115 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q8BGC1 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q8BGC1 Ncoa2-201ENSMUST00000006037 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q8BGC1 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q8BGC1 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q8BGC1 Slc36a2-201ENSMUST00000039305 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q8BGC1 Gm10748-202ENSMUST00000194396 2379 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Q8BGC1 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q8BGC1 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q8BGC1 Micalcl-203ENSMUST00000106645 2309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q8BGC1 5330439K02Rik-201ENSMUST00000180953 2312 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q8BGC1 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q8BGC1 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q8BGC1 Fgd4-204ENSMUST00000161188 2214 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q8BGC1 Dcx-204ENSMUST00000112856 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q8BGC1 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q8BGC1 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q8BGC1 Shcbp1-201ENSMUST00000022945 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q8BGC1 Gm8216-201ENSMUST00000117232 601 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Q8BGC1 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q8BGC1 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q8BGC1 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q8BGC1 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q8BGC1 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q8BGC1 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Q8BGC1 Gm5801-201ENSMUST00000182247 780 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Q8BGC1 Gsdmc3-203ENSMUST00000190682 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q8BGC1 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q8BGC1 Enthd1-201ENSMUST00000096347 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q8BGC1 4631405J19Rik-202ENSMUST00000111270 2909 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q8BGC1 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q8BGC1 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q8BGC1 Thap2-201ENSMUST00000020346 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q8BGC1 Pus7l-201ENSMUST00000049151 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q8BGC1 Zfp7-201ENSMUST00000023179 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q8BGC1 Gm44933-201ENSMUST00000208637 1987 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q8BGC1 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q8BGC1 Ndufab1-201ENSMUST00000033157 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q8BGC1 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q8BGC1 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q8BGC1 5830462I19Rik-201ENSMUST00000168137 3383 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Q8BGC1 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q8BGC1 A1bg-201ENSMUST00000096418 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q8BGC1 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q8BGC1 Atxn1-203ENSMUST00000180110 3901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q8BGC1 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q8BGC1 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q8BGC1 Bpifb2-201ENSMUST00000028983 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q8BGC1 Rpgr-202ENSMUST00000072393 2380 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q8BGC1 Dcaf12l1-201ENSMUST00000060481 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q8BGC1 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q8BGC1 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q8BGC1 2210010C04Rik-201ENSMUST00000031931 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q8BGC1 Fam13c-203ENSMUST00000173042 3310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q8BGC1 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q8BGC1 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms