Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Gm15631-201ENSMUST00000142962 2436 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Syne3Q4FZC9 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Syne3Q4FZC9 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Syne3Q4FZC9 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Syne3Q4FZC9 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Syne3Q4FZC9 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Syne3Q4FZC9 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Syne3Q4FZC9 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Syne3Q4FZC9 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Syne3Q4FZC9 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Syne3Q4FZC9 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Syne3Q4FZC9 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Syne3Q4FZC9 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Syne3Q4FZC9 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Syne3Q4FZC9 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Syne3Q4FZC9 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Syne3Q4FZC9 Plcxd2-201ENSMUST00000130481 7140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Syne3Q4FZC9 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Syne3Q4FZC9 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Syne3Q4FZC9 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Syne3Q4FZC9 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Syne3Q4FZC9 Dopey2-201ENSMUST00000045004 7319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Syne3Q4FZC9 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Syne3Q4FZC9 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Syne3Q4FZC9 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Syne3Q4FZC9 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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