Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ACTBP60709 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ACTBP60709 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
ACTBP60709 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ACTBP60709 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ACTBP60709 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ACTBP60709 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ACTBP60709 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ACTBP60709 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
ACTBP60709 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
ACTBP60709 EEF2K-201ENST00000263026 7388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ACTBP60709 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ACTBP60709 MAD1L1-201ENST00000265854 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ACTBP60709 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ACTBP60709 LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 2190 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ACTBP60709 CYYR1-201ENST00000299340 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ACTBP60709 NTNG1-206ENST00000370071 3149 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ACTBP60709 DDX19B-202ENST00000355992 1692 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ACTBP60709 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ACTBP60709 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ACTBP60709 HSPH1-204ENST00000445273 4987 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ACTBP60709 LINC01114-202ENST00000424321 2112 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ACTBP60709 ARAP3-207ENST00000626478 4928 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ACTBP60709 AKNA-201ENST00000223791 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ACTBP60709 ZNF747-201ENST00000252799 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ACTBP60709 ZFYVE19-209ENST00000564258 2059 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ACTBP60709 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ACTBP60709 USP40-201ENST00000251722 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ACTBP60709 CCDC186-201ENST00000369285 2035 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ACTBP60709 TBX4-202ENST00000393853 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ACTBP60709 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ACTBP60709 DDX5-210ENST00000578804 2021 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ACTBP60709 PHF19-202ENST00000373896 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ACTBP60709 FLNA-204ENST00000369856 8241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ACTBP60709 TUBGCP5-208ENST00000620435 3342 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ACTBP60709 NKAP-201ENST00000371410 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ACTBP60709 PLCB3-201ENST00000279230 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ACTBP60709 B4GALT4-201ENST00000359213 2385 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ACTBP60709 SULF1-202ENST00000402687 4891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ACTBP60709 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ACTBP60709 GAPDHS-201ENST00000222286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ACTBP60709 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ACTBP60709 FAM76A-204ENST00000373954 3567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ACTBP60709 ZKSCAN3-203ENST00000377255 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ACTBP60709 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ACTBP60709 FAM237B-201ENST00000637645 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ACTBP60709 LINC00563-201ENST00000566370 1400 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ACTBP60709 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ACTBP60709 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ACTBP60709 FAM214B-208ENST00000605244 3016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ACTBP60709 WDR47-204ENST00000369965 4240 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ACTBP60709 TMEM246-202ENST00000374848 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ACTBP60709 RAD1-203ENST00000382038 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ACTBP60709 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ACTBP60709 PAPLN-203ENST00000554301 4090 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ACTBP60709 ZNF621-202ENST00000339296 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ACTBP60709 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ACTBP60709 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ACTBP60709 SLC25A17-217ENST00000544408 2060 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ACTBP60709 AL355336.1-201ENST00000451355 1676 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ACTBP60709 DAPK1-201ENST00000358077 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ACTBP60709 CES1-201ENST00000360526 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ACTBP60709 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ACTBP60709 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ACTBP60709 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ACTBP60709 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ACTBP60709 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ACTBP60709 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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ACTBP60709 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ACTBP60709 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ACTBP60709 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ACTBP60709 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ACTBP60709 HOXB-AS3-209ENST00000477144 743 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ACTBP60709 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ACTBP60709 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ACTBP60709 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ACTBP60709 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ACTBP60709 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ACTBP60709 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ACTBP60709 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ACTBP60709 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ACTBP60709 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ACTBP60709 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ACTBP60709 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ACTBP60709 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ACTBP60709 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ACTBP60709 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ACTBP60709 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ACTBP60709 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ACTBP60709 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ACTBP60709 SLC28A1-201ENST00000286749 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ACTBP60709 AC009123.1-202ENST00000565643 2551 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ACTBP60709 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ACTBP60709 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ACTBP60709 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ACTBP60709 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ACTBP60709 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ACTBP60709 FAM155A-201ENST00000375915 8503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ACTBP60709 RASA4CP-203ENST00000446874 3193 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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