Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Itgal-203ENSMUST00000118405 3909 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TtrP07309 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TtrP07309 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TtrP07309 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TtrP07309 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TtrP07309 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TtrP07309 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TtrP07309 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TtrP07309 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TtrP07309 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TtrP07309 Sap30bpos-201ENSMUST00000132264 2352 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TtrP07309 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TtrP07309 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TtrP07309 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TtrP07309 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TtrP07309 Cul2-206ENSMUST00000162301 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TtrP07309 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TtrP07309 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TtrP07309 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TtrP07309 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TtrP07309 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TtrP07309 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TtrP07309 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TtrP07309 Ank3-237ENSMUST00000183074 4948 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TtrP07309 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TtrP07309 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TtrP07309 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TtrP07309 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TtrP07309 Suclg2-204ENSMUST00000204224 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TtrP07309 Fxyd1-214ENSMUST00000206328 545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TtrP07309 Ccdc15-202ENSMUST00000213633 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TtrP07309 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TtrP07309 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TtrP07309 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TtrP07309 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TtrP07309 Bco1-201ENSMUST00000034308 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TtrP07309 Sdhaf3-201ENSMUST00000040826 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TtrP07309 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TtrP07309 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TtrP07309 Arfgap3-201ENSMUST00000067215 2619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TtrP07309 Gm9992-201ENSMUST00000070059 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TtrP07309 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TtrP07309 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TtrP07309 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TtrP07309 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TtrP07309 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TtrP07309 Kidins220-202ENSMUST00000220459 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
TtrP07309 Scn2b-202ENSMUST00000170998 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
TtrP07309 Napepld-202ENSMUST00000115217 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
TtrP07309 Gmip-201ENSMUST00000036074 3933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
TtrP07309 Nudcd3-201ENSMUST00000066496 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
TtrP07309 Palld-201ENSMUST00000034057 3566 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
TtrP07309 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
TtrP07309 Slc13a4-201ENSMUST00000031868 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
TtrP07309 Phf8-202ENSMUST00000046962 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
TtrP07309 Akap3-203ENSMUST00000202878 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
TtrP07309 Thbs1-201ENSMUST00000039559 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
TtrP07309 Lin54-209ENSMUST00000152387 2760 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
TtrP07309 Anapc15-213ENSMUST00000178851 2797 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.19
TtrP07309 Pdgfrb-202ENSMUST00000115274 5423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
TtrP07309 Gm43086-201ENSMUST00000202536 2657 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
TtrP07309 Adamtsl1-209ENSMUST00000141889 7805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
TtrP07309 Gm44888-201ENSMUST00000209119 2541 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
TtrP07309 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
TtrP07309 Helb-201ENSMUST00000020449 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
TtrP07309 AC122293.1-201ENSMUST00000218333 2231 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
TtrP07309 Arnt2-207ENSMUST00000208232 6047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
TtrP07309 Acsl1-201ENSMUST00000034046 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
TtrP07309 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
TtrP07309 Ppip5k1-203ENSMUST00000110626 5171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
TtrP07309 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
TtrP07309 Slco4c1-201ENSMUST00000071985 4908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
TtrP07309 Sipa1l2-201ENSMUST00000108775 6365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
TtrP07309 Ndrg4-201ENSMUST00000041318 3101 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
TtrP07309 Btrc-206ENSMUST00000224102 3037 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
TtrP07309 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
TtrP07309 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
TtrP07309 Daam1-205ENSMUST00000223272 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
TtrP07309 Clcn3-202ENSMUST00000056508 5684 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
TtrP07309 Stpg2-201ENSMUST00000062306 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
TtrP07309 Tubb5-201ENSMUST00000001566 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
TtrP07309 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
TtrP07309 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
TtrP07309 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
TtrP07309 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
TtrP07309 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
TtrP07309 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
TtrP07309 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
TtrP07309 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
TtrP07309 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
TtrP07309 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
TtrP07309 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
TtrP07309 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
TtrP07309 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
TtrP07309 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
TtrP07309 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
TtrP07309 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
TtrP07309 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
TtrP07309 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
TtrP07309 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms