Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VdrP48281 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VdrP48281 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VdrP48281 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
VdrP48281 Kalrn-203ENSMUST00000114947 2922 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
VdrP48281 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
VdrP48281 Phf21a-202ENSMUST00000068702 6023 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
VdrP48281 Jarid2-208ENSMUST00000173246 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VdrP48281 Gm10417-201ENSMUST00000194341 3522 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
VdrP48281 Kcnip3-203ENSMUST00000103215 2732 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VdrP48281 Kcnip3-201ENSMUST00000028850 2728 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VdrP48281 Cacna1c-202ENSMUST00000078320 8062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VdrP48281 Lhx9-201ENSMUST00000019374 4937 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VdrP48281 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VdrP48281 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VdrP48281 Diaph1-201ENSMUST00000025337 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
VdrP48281 Ncam1-201ENSMUST00000114476 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VdrP48281 Gm21817-201ENSMUST00000178584 2583 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
VdrP48281 Pdlim5-204ENSMUST00000168967 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VdrP48281 Arhgap6-204ENSMUST00000112129 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VdrP48281 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VdrP48281 Kcnv1-201ENSMUST00000022967 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VdrP48281 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VdrP48281 Polr3b-201ENSMUST00000077175 4975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VdrP48281 Lrrk1-201ENSMUST00000015277 7465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VdrP48281 Gckr-202ENSMUST00000201166 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
VdrP48281 Slc16a7-202ENSMUST00000105257 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
VdrP48281 Sall2-201ENSMUST00000058326 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
VdrP48281 4732487G21Rik-201ENSMUST00000181495 2664 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
VdrP48281 Rbp1-201ENSMUST00000052068 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
VdrP48281 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
VdrP48281 Plxnb3-201ENSMUST00000002079 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
VdrP48281 Zdbf2-201ENSMUST00000029025 12112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
VdrP48281 Elf5-206ENSMUST00000164172 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
VdrP48281 Slc5a9-201ENSMUST00000102719 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
VdrP48281 Dido1-204ENSMUST00000103055 4613 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
VdrP48281 9130019O22Rik-201ENSMUST00000049052 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
VdrP48281 Txnrd1-201ENSMUST00000020484 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
VdrP48281 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
VdrP48281 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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VdrP48281 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
VdrP48281 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
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VdrP48281 Eif5a-212ENSMUST00000153652 840 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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VdrP48281 Gm37355-201ENSMUST00000193345 606 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
VdrP48281 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
VdrP48281 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
VdrP48281 Gm36028-202ENSMUST00000205931 1161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
VdrP48281 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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VdrP48281 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
VdrP48281 Gm44445-201ENSMUST00000204075 2683 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
VdrP48281 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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VdrP48281 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
VdrP48281 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
VdrP48281 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VdrP48281 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VdrP48281 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VdrP48281 Nktr-201ENSMUST00000035112 7022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VdrP48281 Uroc1-201ENSMUST00000046128 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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VdrP48281 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VdrP48281 Lrsam1-202ENSMUST00000113200 4030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
VdrP48281 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
VdrP48281 AC163296.2-201ENSMUST00000220177 1315 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
VdrP48281 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VdrP48281 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
VdrP48281 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VdrP48281 Dchs2-201ENSMUST00000191829 10783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
VdrP48281 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
VdrP48281 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
VdrP48281 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
VdrP48281 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
VdrP48281 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
VdrP48281 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
VdrP48281 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
VdrP48281 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
VdrP48281 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms