Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Loxl3-202ENSMUST00000101257 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Dctn1-204ENSMUST00000113918 4321 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Cacna1f-201ENSMUST00000115725 6028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Ptk2b-203ENSMUST00000111121 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 5730596B20Rik-201ENSMUST00000070587 3354 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Sh3rf2-201ENSMUST00000072008 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 C030014I23Rik-204ENSMUST00000217463 1370 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Suclg2-204ENSMUST00000204224 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Stox2-206ENSMUST00000210030 2734 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Ccdc87-201ENSMUST00000088653 3163 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Ndrg4-202ENSMUST00000073139 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Exoc3l4-210ENSMUST00000223050 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Top1-201ENSMUST00000109468 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Prrg3-201ENSMUST00000048790 5931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Arfgap3-201ENSMUST00000067215 2619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Ppp4r1-204ENSMUST00000160664 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Ccr6-204ENSMUST00000167956 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Gm37390-201ENSMUST00000192452 872 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Gm44420-201ENSMUST00000203669 490 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Mir194-2-201ENSMUST00000083648 86 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Ik-201ENSMUST00000007042 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Gm7052-201ENSMUST00000167568 1512 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 N4bp2-201ENSMUST00000087264 5308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Nfrkb-201ENSMUST00000086167 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Jarid2-208ENSMUST00000173246 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Hnrnpk-216ENSMUST00000177019 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 4933439C10Rik-203ENSMUST00000132226 3184 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 D630003M21Rik-202ENSMUST00000103121 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Rxfp2-202ENSMUST00000110496 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Zfp423-203ENSMUST00000165770 4334 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Nav2-204ENSMUST00000183659 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Gpm6b-206ENSMUST00000112228 3083 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Cux1-207ENSMUST00000176216 2821 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Uroc1-201ENSMUST00000046128 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Timm9-208ENSMUST00000221797 2564 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Zfp74-204ENSMUST00000108212 2060 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Hspa12a-201ENSMUST00000066285 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Ighv1-12-201ENSMUST00000103500 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Pxdn-208ENSMUST00000220271 6377 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Gm5189-201ENSMUST00000221796 261 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Olfr6-203ENSMUST00000213651 4457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Mlxipl-201ENSMUST00000005507 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Eb1P04230 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms