Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Ptprm-201ENSMUST00000037974 5186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Prrg3-201ENSMUST00000048790 5931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Gm8016-201ENSMUST00000221830 1575 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Lrrk1-201ENSMUST00000015277 7465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Smchd1-201ENSMUST00000127430 7052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Dcaf12l1-201ENSMUST00000060481 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Kcne4-201ENSMUST00000057262 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Adgre5-202ENSMUST00000075843 3000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Dcc-201ENSMUST00000073379 4855 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Ndrg4-202ENSMUST00000073139 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Diaph1-201ENSMUST00000025337 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Gm42571-201ENSMUST00000201197 2464 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Gm45837-201ENSMUST00000084894 4139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Slc7a3-202ENSMUST00000101362 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 4932430I15Rik-201ENSMUST00000180431 3306 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Nfkbiz-204ENSMUST00000114458 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Tnfrsf9-204ENSMUST00000105672 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp940-202ENSMUST00000108223 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Gm44420-201ENSMUST00000203669 490 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Gm9220-201ENSMUST00000190721 2544 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Scmh1-202ENSMUST00000064991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Ppp4r1-204ENSMUST00000160664 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Txndc16-205ENSMUST00000139526 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Kif3a-202ENSMUST00000118353 2178 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Tyw3-204ENSMUST00000170461 4270 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Slfn3-201ENSMUST00000019130 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Tchhl1-201ENSMUST00000029516 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Pard3-201ENSMUST00000026921 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 4930417O13Rik-203ENSMUST00000204911 3458 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26586-201ENSMUST00000181918 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Ep400-210ENSMUST00000146458 3673 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Tfdp1-204ENSMUST00000209885 2511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Adamtsl4-201ENSMUST00000015994 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Prnd-201ENSMUST00000110169 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Mymk-201ENSMUST00000009358 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Amer3-201ENSMUST00000052670 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Tada2a-201ENSMUST00000018795 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Tmprss11c-201ENSMUST00000059424 1615 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Ahrr-202ENSMUST00000109640 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Itgax-201ENSMUST00000033053 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Umodl1-203ENSMUST00000114555 5041 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Il17ra-201ENSMUST00000002976 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 9130019O22Rik-201ENSMUST00000049052 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Ccdc33-204ENSMUST00000119665 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Kif2a-206ENSMUST00000159772 2570 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Bex3-203ENSMUST00000113113 766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11988-201ENSMUST00000122321 1069 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Gm37020-201ENSMUST00000195303 992 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Gm42710-201ENSMUST00000200608 985 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Gm46328-201ENSMUST00000217924 976 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Epb41-204ENSMUST00000105970 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Gm42521-201ENSMUST00000199190 2040 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Nrap-205ENSMUST00000167239 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ccdc28aQ8CEI3 Tial1-202ENSMUST00000106226 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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