Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 Oas1h-201ENSMUST00000072476 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rdh13Q8CEE7 5730596B20Rik-201ENSMUST00000070587 3354 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rdh13Q8CEE7 Dctn1-202ENSMUST00000113907 4205 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rdh13Q8CEE7 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rdh13Q8CEE7 Zc3hav1-202ENSMUST00000114898 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rdh13Q8CEE7 Ptk2b-202ENSMUST00000089250 3903 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rdh13Q8CEE7 Plxnb3-201ENSMUST00000002079 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rdh13Q8CEE7 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rdh13Q8CEE7 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rdh13Q8CEE7 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rdh13Q8CEE7 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rdh13Q8CEE7 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rdh13Q8CEE7 4921508D12Rik-201ENSMUST00000124095 1075 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rdh13Q8CEE7 Gm11915-201ENSMUST00000153669 358 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rdh13Q8CEE7 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rdh13Q8CEE7 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rdh13Q8CEE7 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rdh13Q8CEE7 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rdh13Q8CEE7 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rdh13Q8CEE7 AC124581.2-201ENSMUST00000225459 282 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rdh13Q8CEE7 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rdh13Q8CEE7 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rdh13Q8CEE7 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rdh13Q8CEE7 Abcc4-201ENSMUST00000036554 5715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rdh13Q8CEE7 Cux1-207ENSMUST00000176216 2821 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rdh13Q8CEE7 Nktr-201ENSMUST00000035112 7022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rdh13Q8CEE7 Ppp4r1-204ENSMUST00000160664 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rdh13Q8CEE7 Sh3glb1-204ENSMUST00000199531 2584 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rdh13Q8CEE7 N4bp2-201ENSMUST00000087264 5308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rdh13Q8CEE7 A430105I19Rik-201ENSMUST00000059997 4703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rdh13Q8CEE7 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rdh13Q8CEE7 AC242690.1-202ENSMUST00000214616 1742 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rdh13Q8CEE7 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rdh13Q8CEE7 Gm364-201ENSMUST00000114725 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rdh13Q8CEE7 Prnd-201ENSMUST00000110169 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rdh13Q8CEE7 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rdh13Q8CEE7 Lpxn-201ENSMUST00000025601 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh13Q8CEE7 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh13Q8CEE7 Gm21817-201ENSMUST00000178584 2583 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh13Q8CEE7 Ldb3-205ENSMUST00000090040 4981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh13Q8CEE7 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh13Q8CEE7 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh13Q8CEE7 Jarid2-208ENSMUST00000173246 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh13Q8CEE7 Nudcd3-201ENSMUST00000066496 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh13Q8CEE7 4930578C19Rik-201ENSMUST00000044188 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh13Q8CEE7 E2f7-204ENSMUST00000173471 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh13Q8CEE7 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh13Q8CEE7 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh13Q8CEE7 Cdkal1-202ENSMUST00000091674 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh13Q8CEE7 Slc6a12-201ENSMUST00000032200 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh13Q8CEE7 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh13Q8CEE7 Rangap1-203ENSMUST00000171115 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh13Q8CEE7 4632418H02Rik-201ENSMUST00000217287 2721 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh13Q8CEE7 Adig-202ENSMUST00000109484 488 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh13Q8CEE7 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh13Q8CEE7 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh13Q8CEE7 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh13Q8CEE7 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh13Q8CEE7 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh13Q8CEE7 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh13Q8CEE7 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh13Q8CEE7 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh13Q8CEE7 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh13Q8CEE7 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh13Q8CEE7 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh13Q8CEE7 Adig-201ENSMUST00000059889 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh13Q8CEE7 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh13Q8CEE7 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh13Q8CEE7 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh13Q8CEE7 Bbs7-201ENSMUST00000040148 2599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh13Q8CEE7 Taf3-204ENSMUST00000114909 4897 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh13Q8CEE7 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh13Q8CEE7 Rbp1-201ENSMUST00000052068 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh13Q8CEE7 Kcne4-201ENSMUST00000057262 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh13Q8CEE7 Anapc15-213ENSMUST00000178851 2797 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh13Q8CEE7 Tmed5-205ENSMUST00000119437 3436 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh13Q8CEE7 Capn3-206ENSMUST00000110721 2898 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh13Q8CEE7 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh13Q8CEE7 Adat1-202ENSMUST00000120457 1677 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh13Q8CEE7 Gpm6b-206ENSMUST00000112228 3083 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh13Q8CEE7 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh13Q8CEE7 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh13Q8CEE7 Mut-201ENSMUST00000169611 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh13Q8CEE7 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh13Q8CEE7 Vma21-201ENSMUST00000114575 4290 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Fcrl1-202ENSMUST00000163661 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Zdbf2-201ENSMUST00000029025 12112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Dnm2-202ENSMUST00000091087 3450 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Snd1-206ENSMUST00000167201 3781 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Zfp398-202ENSMUST00000114598 8328 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Specc1-208ENSMUST00000201624 2518 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Adamts9-205ENSMUST00000167391 6033 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rdh13Q8CEE7 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.8 ms