Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Plxna3-201ENSMUST00000004326 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Ano1-202ENSMUST00000118556 4566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Ccdc40-201ENSMUST00000035935 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Ldb3-205ENSMUST00000090040 4981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Acsl1-201ENSMUST00000034046 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Pcdhgc5-201ENSMUST00000055935 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Fam229b-208ENSMUST00000139743 679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Fxyd1-214ENSMUST00000206328 545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 4930486N12Rik-201ENSMUST00000206668 632 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 AC124581.2-201ENSMUST00000225459 282 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Phtf1os-201ENSMUST00000160110 4046 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Epn2-203ENSMUST00000108712 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Gria1-201ENSMUST00000036315 5546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 St3gal6-207ENSMUST00000137035 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Pcdha4-201ENSMUST00000192295 4129 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Wdr62-201ENSMUST00000108190 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms