Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Zfp605-202ENSMUST00000112528 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Gm31941-201ENSMUST00000209689 350 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Zc3h18-202ENSMUST00000093073 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Adgre5-202ENSMUST00000075843 3000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Pcdha4-201ENSMUST00000192295 4129 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Prrt4B2RU40 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Gm27177-201ENSMUST00000183339 2946 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Arfgap3-202ENSMUST00000226124 2461 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Gm40634-201ENSMUST00000214129 2001 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Prdx6b-201ENSMUST00000057072 2885 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Echdc1-201ENSMUST00000020034 3856 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 AC121793.2-201ENSMUST00000217127 2728 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Vil1-201ENSMUST00000027366 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Arhgap45-202ENSMUST00000099501 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 5830411N06Rik-203ENSMUST00000164583 3342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms