Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 4631405J19Rik-202ENSMUST00000111270 2909 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Gm40634-201ENSMUST00000214129 2001 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Anxa7-207ENSMUST00000224975 2727 ntAPPRIS P2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Prdm1-204ENSMUST00000218369 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Actn1-202ENSMUST00000167327 2664 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Lrsam1-202ENSMUST00000113200 4030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Dnajc10-201ENSMUST00000028392 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Dpf2-205ENSMUST00000136983 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Gm15612-201ENSMUST00000147542 3118 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Slc12a6-204ENSMUST00000110991 4556 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Folh1-202ENSMUST00000107271 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Msh4-203ENSMUST00000188338 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Gm26772-201ENSMUST00000180466 3429 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Sh3bp1P55194 Anln-201ENSMUST00000040912 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Gm15631-201ENSMUST00000142962 2436 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Tgfbi-201ENSMUST00000045173 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Sgk2-202ENSMUST00000117123 3034 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Acsl5-201ENSMUST00000043150 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Sh3bp1P55194 Sun1-204ENSMUST00000110882 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Sh3bp1P55194 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Sh3bp1P55194 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
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Sh3bp1P55194 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Zfp672-202ENSMUST00000064786 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Cdcp2-201ENSMUST00000062495 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Rnf6-206ENSMUST00000161859 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Src-205ENSMUST00000109533 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Spag6l-201ENSMUST00000023468 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Fcamr-201ENSMUST00000027670 1743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms