Protein–RNA interactions for Protein: P28658

Atxn10, Ataxin-10, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn10P28658 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Slc1a4-202ENSMUST00000109594 3926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Mitf-201ENSMUST00000043628 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Crocc2-201ENSMUST00000138595 7132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Gm17980-201ENSMUST00000217977 2349 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Gm37697-201ENSMUST00000195680 1844 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Nod1-202ENSMUST00000168172 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Igsf6-201ENSMUST00000047194 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Dchs1-201ENSMUST00000078482 10754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Lipg-201ENSMUST00000066532 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Plcxd2-201ENSMUST00000130481 7140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Gm43274-201ENSMUST00000202545 5000 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Rad50-201ENSMUST00000020649 5153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 2210010C04Rik-201ENSMUST00000031931 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Phtf1os-201ENSMUST00000160110 4046 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Zmym6-201ENSMUST00000046751 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Cnppd1-202ENSMUST00000168720 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Mid1-201ENSMUST00000036753 3753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms