Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 A1bg-201ENSMUST00000096418 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Hist1h4i-201ENSMUST00000102977 727 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Gm24470-201ENSMUST00000104486 132 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Ppt1-204ENSMUST00000121870 986 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Gm12916-201ENSMUST00000139012 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Gm23582-201ENSMUST00000158530 139 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Ppy-202ENSMUST00000170554 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Vmn2r-ps13-201ENSMUST00000176920 606 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
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Gm21976J3QNN2 Gm28916-201ENSMUST00000186988 699 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Gm29157-201ENSMUST00000188753 612 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Gm19566-201ENSMUST00000199576 610 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Gm42689-201ENSMUST00000202403 404 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Gm31786-201ENSMUST00000212305 564 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 AC113291.2-201ENSMUST00000215490 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 AC107752.1-201ENSMUST00000219362 469 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Gm36862-204ENSMUST00000223365 642 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 AC154213.1-201ENSMUST00000228234 583 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Gm45663-201ENSMUST00000210429 1632 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Gm21976J3QNN2 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Gm21976J3QNN2 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Gm21976J3QNN2 1700022A22Rik-202ENSMUST00000187130 1458 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Gm21976J3QNN2 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Bzw2-201ENSMUST00000020856 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Gm21976J3QNN2 Rab29-202ENSMUST00000112386 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Gm21976J3QNN2 Ly6i-202ENSMUST00000166694 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Gal3st2b-201ENSMUST00000177958 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 C430039J16Rik-201ENSMUST00000181148 658 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Gm21976J3QNN2 Gm3791-201ENSMUST00000220790 768 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
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Gm21976J3QNN2 Gm26861-207ENSMUST00000223253 1095 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 AC149294.3-201ENSMUST00000226888 732 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Mrps18b-201ENSMUST00000025305 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Klra9-201ENSMUST00000071554 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Ifnl3-201ENSMUST00000078364 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Olfr169-201ENSMUST00000090062 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Defa3-201ENSMUST00000098893 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Trim34b-202ENSMUST00000180136 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Gm26658-201ENSMUST00000181067 2500 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Tpd52-202ENSMUST00000091354 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Gm16429-202ENSMUST00000201400 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Gm7971-201ENSMUST00000086950 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21976J3QNN2 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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