Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Itga10-202ENSMUST00000119365 5035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Ttc28-206ENSMUST00000156290 10688 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 BC017643-202ENSMUST00000106115 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Prkd3-204ENSMUST00000119284 4743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Olfr1221-202ENSMUST00000143255 2800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Gm16348-202ENSMUST00000146654 2385 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Baiap3-201ENSMUST00000169109 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Ftsj3-201ENSMUST00000021048 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Rabgef1-201ENSMUST00000026390 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Mc3r-201ENSMUST00000038532 2623 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Herc3-202ENSMUST00000041401 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Ccdc40-202ENSMUST00000053440 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Sept6-202ENSMUST00000060474 3457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Olfr709-ps1-201ENSMUST00000072368 924 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Bcl2l11-202ENSMUST00000089634 2301 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Cdk20-201ENSMUST00000021939 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Tecta-203ENSMUST00000160940 7048 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Gm26805-201ENSMUST00000181885 3089 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Mmel1-201ENSMUST00000079269 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Ptpre-204ENSMUST00000209979 4959 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Gpr63-201ENSMUST00000038920 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Grb2-204ENSMUST00000106499 2333 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Celf2-211ENSMUST00000142941 2338 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Msln-201ENSMUST00000075884 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Gm9866-205ENSMUST00000220998 1973 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Pitrm1-207ENSMUST00000222485 3906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Homer1-204ENSMUST00000102752 5713 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Cpsf3-211ENSMUST00000222968 1858 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Ccdc136-209ENSMUST00000181464 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Arhgap19-201ENSMUST00000026150 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Dlgap4-202ENSMUST00000070782 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Sf3b2-201ENSMUST00000025774 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Gm7061-201ENSMUST00000118127 1416 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Gmeb2-201ENSMUST00000049032 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Trak1-211ENSMUST00000211187 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Kcne4-201ENSMUST00000057262 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Tec-203ENSMUST00000113594 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Gm42638-201ENSMUST00000196065 2587 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Gm11736-201ENSMUST00000121468 505 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 4930505M18Rik-201ENSMUST00000175854 1288 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Gm7594-201ENSMUST00000218595 871 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Adamts6-201ENSMUST00000065766 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Mir9-3hg-202ENSMUST00000181511 3412 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Kcnh6-201ENSMUST00000001965 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Ctnnd1-217ENSMUST00000111691 5380 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Bco2-201ENSMUST00000119103 2118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Wdr6-201ENSMUST00000068700 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Hcfc1-202ENSMUST00000114372 8262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Zfp568-204ENSMUST00000177931 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Celf4-202ENSMUST00000115816 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Zfp451-202ENSMUST00000044455 11876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Gpatch8-206ENSMUST00000143842 6871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Gm26704-201ENSMUST00000181362 2901 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Ap3m1-206ENSMUST00000154460 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Gal3st2-201ENSMUST00000094663 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Plrg1-204ENSMUST00000150268 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Olfr450-202ENSMUST00000218832 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Gm40655-201ENSMUST00000220802 1880 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Nbr1-202ENSMUST00000103098 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 4932702P03Rik-202ENSMUST00000151220 2792 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Gm42633-201ENSMUST00000198853 2764 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Col4a5-201ENSMUST00000112930 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Tbc1d24-214ENSMUST00000201960 4305 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms