Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Rab29-202ENSMUST00000112386 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Zfp961-204ENSMUST00000136516 601 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Gm16322-202ENSMUST00000141275 700 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Gm13842-202ENSMUST00000156331 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Gm23432-201ENSMUST00000157181 131 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Gm18182-201ENSMUST00000191380 1251 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Gm5190-201ENSMUST00000192434 357 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Gm43777-201ENSMUST00000197269 376 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Gm44236-201ENSMUST00000204492 513 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Gm29328-212ENSMUST00000209182 1168 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Eif3m-201ENSMUST00000028592 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Ascl3-201ENSMUST00000035372 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 2010001K21Rik-201ENSMUST00000060680 519 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Olfr47-201ENSMUST00000078057 1059 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Gm6783-201ENSMUST00000120916 1437 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Dph5-202ENSMUST00000106505 1836 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Mrpl24-202ENSMUST00000119968 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Gm4865-201ENSMUST00000196284 1309 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Atp6v1c2-202ENSMUST00000095820 1549 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Cav2-203ENSMUST00000115462 694 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Rptoros-201ENSMUST00000127450 1174 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Gng2-203ENSMUST00000159073 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Tnnc1-202ENSMUST00000169169 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Mir7088-201ENSMUST00000184227 86 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Gm2474-201ENSMUST00000195162 559 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Rhoc-205ENSMUST00000196817 877 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Gm9515-201ENSMUST00000200276 647 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Gm44777-203ENSMUST00000206930 571 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Gm32743-201ENSMUST00000214196 594 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 AC113291.2-201ENSMUST00000215490 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Gm19605-205ENSMUST00000221712 677 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 AC165260.2-201ENSMUST00000225371 395 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Cdkn3-201ENSMUST00000067426 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Srp14-201ENSMUST00000009693 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Gm10617-201ENSMUST00000098368 1172 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Olfr95-201ENSMUST00000060728 5129 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmeff1Q6PFE7 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Spef2-203ENSMUST00000159368 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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