Protein–RNA interactions for Protein: P50446

Krt6a, Keratin, type II cytoskeletal 6A, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt6aP50446 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Clock-201ENSMUST00000075159 7478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Gria1-201ENSMUST00000036315 5546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Rpap2-201ENSMUST00000065422 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Morf4l2-215ENSMUST00000169418 1782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Lox-202ENSMUST00000171470 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 4921508D12Rik-201ENSMUST00000124095 1075 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Gm35584-201ENSMUST00000191767 641 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Thyn1-202ENSMUST00000213683 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Ly9-203ENSMUST00000111277 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Pxdn-208ENSMUST00000220271 6377 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Gm37567-201ENSMUST00000193241 2279 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Uroc1-201ENSMUST00000046128 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 A830010M20Rik-208ENSMUST00000211896 5256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Zfp423-203ENSMUST00000165770 4334 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Bcorl1-203ENSMUST00000136348 7446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Fubp1-201ENSMUST00000106121 4525 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 N4bp2l1-205ENSMUST00000202031 1864 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Srpk1-204ENSMUST00000130643 4465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Gm498-202ENSMUST00000152910 1507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Traf3-201ENSMUST00000021706 7060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Exo1-201ENSMUST00000039725 7796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Doxl2-203ENSMUST00000184917 2468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Trim34a-201ENSMUST00000060315 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Ccdc15-202ENSMUST00000213633 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Nrp2-202ENSMUST00000063594 6342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Acot11-202ENSMUST00000102762 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Lig4-201ENSMUST00000095476 5028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Olfr6-203ENSMUST00000213651 4457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Ano1-202ENSMUST00000118556 4566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Adig-202ENSMUST00000109484 488 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Rhox2-ps-201ENSMUST00000117421 322 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Gm25661-201ENSMUST00000157704 296 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 AC124581.2-201ENSMUST00000225459 282 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Adig-201ENSMUST00000059889 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Git2-203ENSMUST00000112183 4886 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Spata31d1a-201ENSMUST00000066510 4261 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Bcl2l1-206ENSMUST00000140436 1865 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Clip3-201ENSMUST00000014065 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Dcaf12l1-201ENSMUST00000060481 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Ighmbp2-201ENSMUST00000025751 3720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Slc5a9-201ENSMUST00000102719 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Anapc15-213ENSMUST00000178851 2797 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Suclg2-204ENSMUST00000204224 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC10.58□□□□□ -0.71
Krt6aP50446 Ldb3-205ENSMUST00000090040 4981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krt6aP50446 Myom2-201ENSMUST00000033842 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krt6aP50446 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krt6aP50446 Cdcp2-201ENSMUST00000062495 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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