Protein–RNA interactions for Protein: P28658

Atxn10, Ataxin-10, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn10P28658 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Gm20715-201ENSMUST00000054781 4460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Serpinb6b-203ENSMUST00000164541 1719 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Kif3c-201ENSMUST00000020999 6791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Hrh1-201ENSMUST00000088987 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Ank3-242ENSMUST00000183261 4999 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Atxn10P28658 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Hivep1-201ENSMUST00000060148 8753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Atxn10P28658 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Atxn10P28658 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Svil-204ENSMUST00000127297 6243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Atxn10P28658 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Atxn10P28658 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Atxn10P28658 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Atxn10P28658 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Atxn10P28658 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atxn10P28658 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Atxn10P28658 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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