Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 Gm43135-201ENSMUST00000196442 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Mkrn1-204ENSMUST00000114823 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Gm20658-202ENSMUST00000177059 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Plrg1-204ENSMUST00000150268 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Ccm2-203ENSMUST00000109722 1760 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Arhgap19-201ENSMUST00000026150 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Herc3-202ENSMUST00000041401 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Tmem255a-202ENSMUST00000089054 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Slc26a1-202ENSMUST00000119270 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Slc26a1-204ENSMUST00000163328 3015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Rabgef1-201ENSMUST00000026390 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Carhsp1-201ENSMUST00000008537 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Atp2b2-202ENSMUST00000101044 4586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Tia1-202ENSMUST00000095753 4477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Rel-201ENSMUST00000102864 7466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Gm26805-201ENSMUST00000181885 3089 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Nolc1-209ENSMUST00000225780 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Calr4-201ENSMUST00000030285 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Dysf-203ENSMUST00000113818 6571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Arid1a-201ENSMUST00000008024 6486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Slc27a6-201ENSMUST00000025500 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Gria4-201ENSMUST00000027020 5441 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Hcfc1-202ENSMUST00000114372 8262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Nrxn1-225ENSMUST00000197268 2280 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Ccnc-201ENSMUST00000065928 3484 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Kpna6-202ENSMUST00000102590 5710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Adamtsl3-203ENSMUST00000173287 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Pms1-201ENSMUST00000027267 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Pcdh15-229ENSMUST00000155701 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Ppp4r1-204ENSMUST00000160664 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Gm42638-201ENSMUST00000196065 2587 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Ftsj3-201ENSMUST00000021048 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Gm5592-201ENSMUST00000097044 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Plk4-201ENSMUST00000026858 3479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Stard13-208ENSMUST00000202111 3373 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Olfr1221-202ENSMUST00000143255 2800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Hk1-201ENSMUST00000072357 3639 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Dlgap4-202ENSMUST00000070782 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Tubd1-205ENSMUST00000167178 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Gm37446-201ENSMUST00000193015 4136 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Celf2-211ENSMUST00000142941 2338 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Rnf121-201ENSMUST00000089052 2344 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Uspl1-202ENSMUST00000100410 3148 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Cpsf3-211ENSMUST00000222968 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Clip1-201ENSMUST00000031382 4387 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Alms1-205ENSMUST00000213058 11163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Ube2l3-202ENSMUST00000115699 2906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Dcx-204ENSMUST00000112856 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Smim1-202ENSMUST00000126119 3996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Zmat3-203ENSMUST00000168566 7672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Acsl1-201ENSMUST00000034046 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Trpv5-202ENSMUST00000193503 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Gm37962-201ENSMUST00000195535 2034 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Rassf2-202ENSMUST00000103182 4589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 1700006J14Rik-203ENSMUST00000160091 2629 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Trak1-211ENSMUST00000211187 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Trim30aP15533 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trim30aP15533 Rap1gds1-201ENSMUST00000029796 3383 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trim30aP15533 Eif3c-201ENSMUST00000032992 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trim30aP15533 Tial1-202ENSMUST00000106226 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trim30aP15533 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trim30aP15533 Gm30373-201ENSMUST00000215774 3500 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trim30aP15533 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms