Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Adar-205ENSMUST00000121094 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Zfp418-201ENSMUST00000051435 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Tbc1d31-201ENSMUST00000022992 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Tmem67-202ENSMUST00000108293 3945 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Ampd3-206ENSMUST00000170374 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Prc1-202ENSMUST00000163812 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Cacna2d1-204ENSMUST00000115281 3412 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 4933439C10Rik-203ENSMUST00000132226 3184 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gpr39-201ENSMUST00000027581 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Ptpre-205ENSMUST00000210833 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Zfp330-201ENSMUST00000034147 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gm31941-201ENSMUST00000209689 350 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Nemp2-201ENSMUST00000165859 3396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms