Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Use1Q9CQ56 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Use1Q9CQ56 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Use1Q9CQ56 Slc39a14-210ENSMUST00000152067 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Use1Q9CQ56 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Use1Q9CQ56 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Use1Q9CQ56 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Use1Q9CQ56 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Nme6-206ENSMUST00000197627 905 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms