Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U6N9 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm23255-201ENSMUST00000102244 110 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Tprkb-204ENSMUST00000113752 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm24140-201ENSMUST00000122773 326 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm11670-201ENSMUST00000143435 511 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm23675-201ENSMUST00000157311 125 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm26208-201ENSMUST00000158677 124 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm16538-201ENSMUST00000162407 442 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Ly6i-202ENSMUST00000166694 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U6N9 1700012J22Rik-201ENSMUST00000193492 830 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm37688-201ENSMUST00000195195 465 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U6N9 AC241616.1-201ENSMUST00000213741 166 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm9736-201ENSMUST00000219969 834 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U6N9 AC124581.2-201ENSMUST00000225459 282 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Stpg4-201ENSMUST00000040609 847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm5278-201ENSMUST00000055957 552 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Fabp1-201ENSMUST00000067492 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Tex101-201ENSMUST00000078001 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Mir326-201ENSMUST00000083637 95 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Taf3-204ENSMUST00000114909 4897 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Limch1-201ENSMUST00000038188 5903 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Babam2-202ENSMUST00000071531 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U6N9 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm26818-201ENSMUST00000181367 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U6N9 AC131081.1-201ENSMUST00000219535 1736 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Ppid-201ENSMUST00000029382 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm8094-201ENSMUST00000165136 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Slc1a4-202ENSMUST00000109594 3926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q3U6N9 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Atxn7l1-203ENSMUST00000110824 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Ms4a6b-201ENSMUST00000025580 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Trbv31-201ENSMUST00000103300 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Pxmp4-202ENSMUST00000109703 560 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Ccdc32-203ENSMUST00000110834 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm15982-201ENSMUST00000121681 554 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Platr12-201ENSMUST00000141027 462 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q3U6N9 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Milr1-206ENSMUST00000182896 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm29200-201ENSMUST00000188118 1085 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
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Q3U6N9 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Ifne-201ENSMUST00000056014 664 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q3U6N9 1110034G24Rik-201ENSMUST00000061891 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Olfr63-201ENSMUST00000067840 955 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm26586-201ENSMUST00000181918 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Bckdk-207ENSMUST00000206745 1702 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm6783-201ENSMUST00000120916 1437 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Ccr6-202ENSMUST00000164411 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U6N9 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Nrap-205ENSMUST00000167239 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
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