Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 A830018L16Rik-203ENSMUST00000137824 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Tmbim7-201ENSMUST00000014673 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Sh3bgrl3-202ENSMUST00000105879 518 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Gm12774-201ENSMUST00000117881 416 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 1700112J05Rik-201ENSMUST00000129353 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Rps27-202ENSMUST00000195998 458 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Rab38-202ENSMUST00000208478 579 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 1700029N11Rik-203ENSMUST00000220639 1092 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Htr1b-201ENSMUST00000051005 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 1110017D15Rik-202ENSMUST00000095126 884 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Tbce-201ENSMUST00000039894 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Ppp1r9a-206ENSMUST00000175962 3769 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Zfp133-ps-201ENSMUST00000119058 1802 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Gm3404-201ENSMUST00000110596 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Gm14152-201ENSMUST00000127020 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Csta1-202ENSMUST00000161638 422 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Speer4f2-201ENSMUST00000166086 1278 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Gm3752-202ENSMUST00000167833 450 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Tmem229b-ps-201ENSMUST00000168554 506 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Gm10128-201ENSMUST00000171360 615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Gm2956-202ENSMUST00000178722 450 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Gm24180-201ENSMUST00000179961 110 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Gm20821-202ENSMUST00000180352 684 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Gm10340-202ENSMUST00000188235 615 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Tdrkh-203ENSMUST00000196386 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Gm2566-201ENSMUST00000201267 431 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 AC156016.4-201ENSMUST00000227470 647 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 AC102523.2-201ENSMUST00000227813 983 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Gm8256-202ENSMUST00000227964 828 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Gm16499-201ENSMUST00000204648 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Katnal2-211ENSMUST00000154665 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Gm5310-201ENSMUST00000197861 1511 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Papss1-206ENSMUST00000200527 2811 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Phf21a-205ENSMUST00000111291 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Cyp2b13-201ENSMUST00000005669 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Spaca3-201ENSMUST00000103222 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Gm12011-201ENSMUST00000119734 618 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Gm13372-201ENSMUST00000123129 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Fam240a-201ENSMUST00000177678 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Gm31941-201ENSMUST00000209689 350 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 AC100406.1-201ENSMUST00000217305 480 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Pcbd1-202ENSMUST00000218005 361 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Gm7727-201ENSMUST00000219830 671 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 AC166061.1-201ENSMUST00000225163 1138 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Nmb-201ENSMUST00000026817 705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Wdr20rt-202ENSMUST00000221658 1570 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Cd177-201ENSMUST00000063956 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Ces1a-201ENSMUST00000095211 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Cyp2d9-201ENSMUST00000089129 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Gm13758-201ENSMUST00000118699 743 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Rnasek-203ENSMUST00000141880 465 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Gm26021-201ENSMUST00000158664 131 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Pkib-204ENSMUST00000175852 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Sparc-208ENSMUST00000214685 1269 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Gm5951-201ENSMUST00000220283 504 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Ang2-202ENSMUST00000228835 896 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Gm20953-201ENSMUST00000216399 2614 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Top2aQ01320 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms