Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 2810029C07Rik-201ENSMUST00000180698 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Kcnj5-202ENSMUST00000214223 3101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Adgb-201ENSMUST00000045328 1893 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Sema4g-203ENSMUST00000179305 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Arhgap17-203ENSMUST00000167309 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Fgfr1-213ENSMUST00000167764 2915 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Vash2-202ENSMUST00000166139 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Abca9-201ENSMUST00000044850 6384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Gm9877-201ENSMUST00000064271 2627 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Lrrc61-202ENSMUST00000114545 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Eif4e1b-206ENSMUST00000132728 1897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Sh2d3c-201ENSMUST00000074248 3092 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Casq2-205ENSMUST00000165540 2434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Fam53b-206ENSMUST00000106168 3630 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Gm44445-201ENSMUST00000204075 2683 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Zfp942-202ENSMUST00000091879 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Ncoa7-209ENSMUST00000216172 2026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Oprm1-213ENSMUST00000105604 1616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Sh3bp1P55194 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Sh3bp1P55194 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Sh3bp1P55194 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
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Sh3bp1P55194 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Sh3bp1P55194 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Ddx24-206ENSMUST00000221211 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Gm43589-201ENSMUST00000199400 1523 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Slc6a12-201ENSMUST00000032200 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Npc1l1-201ENSMUST00000004505 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Mical1-201ENSMUST00000019967 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Clcn1-201ENSMUST00000031894 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Anxa11os-201ENSMUST00000184083 2479 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Gm43750-201ENSMUST00000199027 2493 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Gm38001-201ENSMUST00000192900 3761 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Park2-209ENSMUST00000191124 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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