Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 Mir124a-1hg-201ENSMUST00000180610 4103 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 Pofut1-207ENSMUST00000152390 4833 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 Gm16288-201ENSMUST00000137940 367 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 4930486N12Rik-201ENSMUST00000206668 632 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 Fam3b-201ENSMUST00000049721 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 Hivep1-201ENSMUST00000060148 8753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 Abcc4-201ENSMUST00000036554 5715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Cdkn1bP46414 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms