Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Dnajc10-201ENSMUST00000028392 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Stau1-202ENSMUST00000109235 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Ctnnd1-220ENSMUST00000111694 6362 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Cd300lg-202ENSMUST00000107163 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Ubn2-205ENSMUST00000160583 14644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Skiv2l-201ENSMUST00000046022 3951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 5830411N06Rik-203ENSMUST00000164583 3342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Utrn-205ENSMUST00000218635 11801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gpr156-201ENSMUST00000061274 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 2310065F04Rik-201ENSMUST00000125538 2724 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Cdk12-201ENSMUST00000003203 4837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Ctc1-202ENSMUST00000116359 3978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Eno2-201ENSMUST00000004378 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Vpreb2P13373 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Igf1r-201ENSMUST00000005671 11409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Erc1-203ENSMUST00000183703 8760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Urb1-203ENSMUST00000140920 7344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Slc14a2-201ENSMUST00000025434 2793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Fgf1-202ENSMUST00000115582 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Rbm10-204ENSMUST00000115374 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Adamts13-202ENSMUST00000102891 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 St5-204ENSMUST00000168005 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Adcy4-201ENSMUST00000002398 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 R3hdm2-218ENSMUST00000170336 3639 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms