Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXZ1

Ndufs4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs4Q9CXZ1 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ndufs4Q9CXZ1 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ndufs4Q9CXZ1 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ndufs4Q9CXZ1 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ndufs4Q9CXZ1 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ndufs4Q9CXZ1 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ndufs4Q9CXZ1 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ndufs4Q9CXZ1 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ndufs4Q9CXZ1 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ndufs4Q9CXZ1 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ndufs4Q9CXZ1 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ndufs4Q9CXZ1 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Ndufs4Q9CXZ1 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufs4Q9CXZ1 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufs4Q9CXZ1 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufs4Q9CXZ1 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufs4Q9CXZ1 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufs4Q9CXZ1 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufs4Q9CXZ1 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufs4Q9CXZ1 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufs4Q9CXZ1 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufs4Q9CXZ1 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufs4Q9CXZ1 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufs4Q9CXZ1 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufs4Q9CXZ1 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufs4Q9CXZ1 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufs4Q9CXZ1 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufs4Q9CXZ1 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufs4Q9CXZ1 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufs4Q9CXZ1 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufs4Q9CXZ1 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufs4Q9CXZ1 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufs4Q9CXZ1 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufs4Q9CXZ1 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufs4Q9CXZ1 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufs4Q9CXZ1 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufs4Q9CXZ1 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufs4Q9CXZ1 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufs4Q9CXZ1 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufs4Q9CXZ1 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufs4Q9CXZ1 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufs4Q9CXZ1 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufs4Q9CXZ1 Adcy7-202ENSMUST00000168545 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufs4Q9CXZ1 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufs4Q9CXZ1 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufs4Q9CXZ1 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufs4Q9CXZ1 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufs4Q9CXZ1 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufs4Q9CXZ1 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufs4Q9CXZ1 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufs4Q9CXZ1 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufs4Q9CXZ1 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufs4Q9CXZ1 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufs4Q9CXZ1 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufs4Q9CXZ1 Cnppd1-202ENSMUST00000168720 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufs4Q9CXZ1 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufs4Q9CXZ1 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufs4Q9CXZ1 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Ndufs4Q9CXZ1 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufs4Q9CXZ1 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufs4Q9CXZ1 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufs4Q9CXZ1 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufs4Q9CXZ1 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufs4Q9CXZ1 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Ndufs4Q9CXZ1 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufs4Q9CXZ1 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufs4Q9CXZ1 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufs4Q9CXZ1 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufs4Q9CXZ1 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufs4Q9CXZ1 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufs4Q9CXZ1 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufs4Q9CXZ1 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufs4Q9CXZ1 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufs4Q9CXZ1 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufs4Q9CXZ1 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufs4Q9CXZ1 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufs4Q9CXZ1 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufs4Q9CXZ1 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufs4Q9CXZ1 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufs4Q9CXZ1 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufs4Q9CXZ1 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufs4Q9CXZ1 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufs4Q9CXZ1 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufs4Q9CXZ1 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufs4Q9CXZ1 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufs4Q9CXZ1 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufs4Q9CXZ1 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufs4Q9CXZ1 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufs4Q9CXZ1 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufs4Q9CXZ1 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufs4Q9CXZ1 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufs4Q9CXZ1 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufs4Q9CXZ1 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufs4Q9CXZ1 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufs4Q9CXZ1 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufs4Q9CXZ1 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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