Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Lrfn5-202ENSMUST00000119481 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Gm16576-201ENSMUST00000128342 5404 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Smchd1-201ENSMUST00000127430 7052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Adar-205ENSMUST00000121094 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Pigk-204ENSMUST00000159899 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Gm36028-202ENSMUST00000205931 1161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Gm40634-201ENSMUST00000214129 2001 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Rnf43-202ENSMUST00000092800 4037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Stat5a-201ENSMUST00000004145 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Shank2-205ENSMUST00000146006 7666 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Clock-201ENSMUST00000075159 7478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Ppp1r3c-201ENSMUST00000087321 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Kcng4-201ENSMUST00000061828 3806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Gckr-202ENSMUST00000201166 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Gm26822-201ENSMUST00000181732 3374 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Tro-201ENSMUST00000087253 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Vwf-203ENSMUST00000112254 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Galnt16-206ENSMUST00000219993 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Lrrk1-201ENSMUST00000015277 7465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Ppp2r2a-201ENSMUST00000089230 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Ptk2b-203ENSMUST00000111121 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Gm44115-201ENSMUST00000203917 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Limch1-201ENSMUST00000038188 5903 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Gm26527-201ENSMUST00000180416 1948 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Ampd3-206ENSMUST00000170374 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Fyn-205ENSMUST00000135242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 0610040B10Rik-202ENSMUST00000162890 600 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Pou2f1-204ENSMUST00000111426 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Ighmbp2-201ENSMUST00000025751 3720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Cacna2d1-204ENSMUST00000115281 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Zc3hav1-201ENSMUST00000031850 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Lpxn-201ENSMUST00000025601 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Helz-202ENSMUST00000100305 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Mllt10-201ENSMUST00000028076 4917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Mfn2-204ENSMUST00000105716 4241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 6430548M08Rik-203ENSMUST00000108950 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Gm43307-201ENSMUST00000199465 2371 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Morc2a-201ENSMUST00000093389 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Zfat-204ENSMUST00000162054 4386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms