Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP5

Vmn1r61, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r61W4VSP5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r61W4VSP5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r61W4VSP5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r61W4VSP5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r61W4VSP5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r61W4VSP5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r61W4VSP5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r61W4VSP5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r61W4VSP5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r61W4VSP5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r61W4VSP5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r61W4VSP5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r61W4VSP5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r61W4VSP5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r61W4VSP5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r61W4VSP5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r61W4VSP5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r61W4VSP5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r61W4VSP5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r61W4VSP5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r61W4VSP5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r61W4VSP5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r61W4VSP5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r61W4VSP5 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r61W4VSP5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r61W4VSP5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r61W4VSP5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r61W4VSP5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r61W4VSP5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r61W4VSP5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r61W4VSP5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r61W4VSP5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r61W4VSP5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r61W4VSP5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r61W4VSP5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r61W4VSP5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r61W4VSP5 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r61W4VSP5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r61W4VSP5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r61W4VSP5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r61W4VSP5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r61W4VSP5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r61W4VSP5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r61W4VSP5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r61W4VSP5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r61W4VSP5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r61W4VSP5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r61W4VSP5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r61W4VSP5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r61W4VSP5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r61W4VSP5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r61W4VSP5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r61W4VSP5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r61W4VSP5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r61W4VSP5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r61W4VSP5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r61W4VSP5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r61W4VSP5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r61W4VSP5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r61W4VSP5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r61W4VSP5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r61W4VSP5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r61W4VSP5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r61W4VSP5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r61W4VSP5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r61W4VSP5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r61W4VSP5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r61W4VSP5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r61W4VSP5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r61W4VSP5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r61W4VSP5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r61W4VSP5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r61W4VSP5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r61W4VSP5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r61W4VSP5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r61W4VSP5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r61W4VSP5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r61W4VSP5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r61W4VSP5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r61W4VSP5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r61W4VSP5 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r61W4VSP5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r61W4VSP5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r61W4VSP5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r61W4VSP5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r61W4VSP5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r61W4VSP5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r61W4VSP5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r61W4VSP5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r61W4VSP5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r61W4VSP5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r61W4VSP5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r61W4VSP5 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r61W4VSP5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r61W4VSP5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r61W4VSP5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r61W4VSP5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r61W4VSP5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r61W4VSP5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r61W4VSP5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.6 ms