Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Hdac5Q9Z2V6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Hdac5Q9Z2V6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Hdac5Q9Z2V6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Hdac5Q9Z2V6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Hdac5Q9Z2V6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Hdac5Q9Z2V6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Hdac5Q9Z2V6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Hdac5Q9Z2V6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Hdac5Q9Z2V6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Hdac5Q9Z2V6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Hdac5Q9Z2V6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Hdac5Q9Z2V6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Hdac5Q9Z2V6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Hdac5Q9Z2V6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Hdac5Q9Z2V6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Hdac5Q9Z2V6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Hdac5Q9Z2V6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Hdac5Q9Z2V6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Hdac5Q9Z2V6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Hdac5Q9Z2V6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Hdac5Q9Z2V6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Hdac5Q9Z2V6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Hdac5Q9Z2V6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Hdac5Q9Z2V6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Hdac5Q9Z2V6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Hdac5Q9Z2V6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Hdac5Q9Z2V6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Hdac5Q9Z2V6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Hdac5Q9Z2V6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Hdac5Q9Z2V6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Hdac5Q9Z2V6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Hdac5Q9Z2V6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Hdac5Q9Z2V6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Hdac5Q9Z2V6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Hdac5Q9Z2V6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Hdac5Q9Z2V6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Hdac5Q9Z2V6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Hdac5Q9Z2V6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Hdac5Q9Z2V6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Hdac5Q9Z2V6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Hdac5Q9Z2V6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Hdac5Q9Z2V6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Hdac5Q9Z2V6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Hdac5Q9Z2V6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Hdac5Q9Z2V6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Hdac5Q9Z2V6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Hdac5Q9Z2V6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Hdac5Q9Z2V6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Hdac5Q9Z2V6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Hdac5Q9Z2V6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Hdac5Q9Z2V6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Hdac5Q9Z2V6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Hdac5Q9Z2V6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Hdac5Q9Z2V6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Hdac5Q9Z2V6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Hdac5Q9Z2V6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Hdac5Q9Z2V6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Hdac5Q9Z2V6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Hdac5Q9Z2V6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Hdac5Q9Z2V6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Hdac5Q9Z2V6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Hdac5Q9Z2V6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Hdac5Q9Z2V6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Hdac5Q9Z2V6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Hdac5Q9Z2V6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Hdac5Q9Z2V6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Hdac5Q9Z2V6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Hdac5Q9Z2V6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Hdac5Q9Z2V6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Hdac5Q9Z2V6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Hdac5Q9Z2V6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Hdac5Q9Z2V6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Hdac5Q9Z2V6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Hdac5Q9Z2V6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Hdac5Q9Z2V6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Hdac5Q9Z2V6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Hdac5Q9Z2V6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Hdac5Q9Z2V6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Hdac5Q9Z2V6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Hdac5Q9Z2V6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Hdac5Q9Z2V6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Hdac5Q9Z2V6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Hdac5Q9Z2V6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Hdac5Q9Z2V6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Hdac5Q9Z2V6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Hdac5Q9Z2V6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Hdac5Q9Z2V6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Hdac5Q9Z2V6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Hdac5Q9Z2V6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Hdac5Q9Z2V6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Hdac5Q9Z2V6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Hdac5Q9Z2V6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Hdac5Q9Z2V6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Hdac5Q9Z2V6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Hdac5Q9Z2V6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Hdac5Q9Z2V6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Hdac5Q9Z2V6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Hdac5Q9Z2V6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Hdac5Q9Z2V6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms