Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E1

Mbd2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd2Q9Z2E1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd2Q9Z2E1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd2Q9Z2E1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd2Q9Z2E1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd2Q9Z2E1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd2Q9Z2E1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd2Q9Z2E1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd2Q9Z2E1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd2Q9Z2E1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd2Q9Z2E1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd2Q9Z2E1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd2Q9Z2E1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd2Q9Z2E1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd2Q9Z2E1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd2Q9Z2E1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd2Q9Z2E1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbd2Q9Z2E1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbd2Q9Z2E1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbd2Q9Z2E1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbd2Q9Z2E1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbd2Q9Z2E1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbd2Q9Z2E1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbd2Q9Z2E1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbd2Q9Z2E1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbd2Q9Z2E1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbd2Q9Z2E1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbd2Q9Z2E1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbd2Q9Z2E1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbd2Q9Z2E1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbd2Q9Z2E1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbd2Q9Z2E1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbd2Q9Z2E1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbd2Q9Z2E1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbd2Q9Z2E1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbd2Q9Z2E1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbd2Q9Z2E1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mbd2Q9Z2E1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mbd2Q9Z2E1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mbd2Q9Z2E1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mbd2Q9Z2E1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mbd2Q9Z2E1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mbd2Q9Z2E1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mbd2Q9Z2E1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mbd2Q9Z2E1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mbd2Q9Z2E1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Mbd2Q9Z2E1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mbd2Q9Z2E1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mbd2Q9Z2E1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mbd2Q9Z2E1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mbd2Q9Z2E1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mbd2Q9Z2E1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mbd2Q9Z2E1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mbd2Q9Z2E1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mbd2Q9Z2E1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mbd2Q9Z2E1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mbd2Q9Z2E1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mbd2Q9Z2E1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mbd2Q9Z2E1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mbd2Q9Z2E1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mbd2Q9Z2E1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mbd2Q9Z2E1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mbd2Q9Z2E1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mbd2Q9Z2E1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mbd2Q9Z2E1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mbd2Q9Z2E1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mbd2Q9Z2E1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mbd2Q9Z2E1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mbd2Q9Z2E1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mbd2Q9Z2E1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mbd2Q9Z2E1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mbd2Q9Z2E1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mbd2Q9Z2E1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mbd2Q9Z2E1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mbd2Q9Z2E1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mbd2Q9Z2E1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mbd2Q9Z2E1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mbd2Q9Z2E1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mbd2Q9Z2E1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mbd2Q9Z2E1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Mbd2Q9Z2E1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mbd2Q9Z2E1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Mbd2Q9Z2E1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mbd2Q9Z2E1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mbd2Q9Z2E1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mbd2Q9Z2E1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mbd2Q9Z2E1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mbd2Q9Z2E1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mbd2Q9Z2E1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mbd2Q9Z2E1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mbd2Q9Z2E1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mbd2Q9Z2E1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mbd2Q9Z2E1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mbd2Q9Z2E1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mbd2Q9Z2E1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mbd2Q9Z2E1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Mbd2Q9Z2E1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mbd2Q9Z2E1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mbd2Q9Z2E1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mbd2Q9Z2E1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Mbd2Q9Z2E1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms