Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cldn6Q9Z262 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Cldn6Q9Z262 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cldn6Q9Z262 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cldn6Q9Z262 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cldn6Q9Z262 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cldn6Q9Z262 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn6Q9Z262 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn6Q9Z262 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn6Q9Z262 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn6Q9Z262 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cldn6Q9Z262 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cldn6Q9Z262 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cldn6Q9Z262 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cldn6Q9Z262 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Cldn6Q9Z262 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cldn6Q9Z262 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cldn6Q9Z262 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cldn6Q9Z262 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cldn6Q9Z262 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cldn6Q9Z262 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cldn6Q9Z262 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cldn6Q9Z262 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cldn6Q9Z262 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cldn6Q9Z262 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cldn6Q9Z262 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cldn6Q9Z262 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cldn6Q9Z262 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cldn6Q9Z262 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cldn6Q9Z262 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cldn6Q9Z262 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cldn6Q9Z262 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn6Q9Z262 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn6Q9Z262 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn6Q9Z262 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn6Q9Z262 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn6Q9Z262 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn6Q9Z262 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn6Q9Z262 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn6Q9Z262 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn6Q9Z262 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn6Q9Z262 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn6Q9Z262 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn6Q9Z262 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn6Q9Z262 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn6Q9Z262 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn6Q9Z262 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn6Q9Z262 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn6Q9Z262 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn6Q9Z262 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn6Q9Z262 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn6Q9Z262 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn6Q9Z262 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn6Q9Z262 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn6Q9Z262 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn6Q9Z262 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn6Q9Z262 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn6Q9Z262 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn6Q9Z262 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn6Q9Z262 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn6Q9Z262 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn6Q9Z262 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn6Q9Z262 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn6Q9Z262 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn6Q9Z262 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn6Q9Z262 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn6Q9Z262 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn6Q9Z262 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn6Q9Z262 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn6Q9Z262 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn6Q9Z262 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn6Q9Z262 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn6Q9Z262 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn6Q9Z262 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn6Q9Z262 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn6Q9Z262 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn6Q9Z262 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn6Q9Z262 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn6Q9Z262 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn6Q9Z262 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn6Q9Z262 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn6Q9Z262 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn6Q9Z262 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn6Q9Z262 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Cldn6Q9Z262 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cldn6Q9Z262 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cldn6Q9Z262 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cldn6Q9Z262 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cldn6Q9Z262 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cldn6Q9Z262 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cldn6Q9Z262 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cldn6Q9Z262 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cldn6Q9Z262 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cldn6Q9Z262 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cldn6Q9Z262 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn6Q9Z262 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn6Q9Z262 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn6Q9Z262 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn6Q9Z262 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn6Q9Z262 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms