Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccne2Q9Z238 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccne2Q9Z238 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccne2Q9Z238 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccne2Q9Z238 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccne2Q9Z238 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccne2Q9Z238 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccne2Q9Z238 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccne2Q9Z238 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccne2Q9Z238 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccne2Q9Z238 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccne2Q9Z238 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccne2Q9Z238 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccne2Q9Z238 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccne2Q9Z238 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccne2Q9Z238 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccne2Q9Z238 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccne2Q9Z238 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccne2Q9Z238 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccne2Q9Z238 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccne2Q9Z238 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccne2Q9Z238 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccne2Q9Z238 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccne2Q9Z238 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccne2Q9Z238 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccne2Q9Z238 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccne2Q9Z238 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccne2Q9Z238 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccne2Q9Z238 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccne2Q9Z238 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccne2Q9Z238 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccne2Q9Z238 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccne2Q9Z238 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccne2Q9Z238 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccne2Q9Z238 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccne2Q9Z238 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccne2Q9Z238 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccne2Q9Z238 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccne2Q9Z238 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccne2Q9Z238 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccne2Q9Z238 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccne2Q9Z238 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccne2Q9Z238 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccne2Q9Z238 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccne2Q9Z238 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccne2Q9Z238 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccne2Q9Z238 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccne2Q9Z238 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccne2Q9Z238 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccne2Q9Z238 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccne2Q9Z238 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccne2Q9Z238 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccne2Q9Z238 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccne2Q9Z238 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccne2Q9Z238 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccne2Q9Z238 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccne2Q9Z238 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccne2Q9Z238 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccne2Q9Z238 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccne2Q9Z238 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccne2Q9Z238 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccne2Q9Z238 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccne2Q9Z238 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccne2Q9Z238 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccne2Q9Z238 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccne2Q9Z238 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccne2Q9Z238 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccne2Q9Z238 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccne2Q9Z238 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccne2Q9Z238 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccne2Q9Z238 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccne2Q9Z238 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccne2Q9Z238 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccne2Q9Z238 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccne2Q9Z238 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccne2Q9Z238 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccne2Q9Z238 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccne2Q9Z238 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccne2Q9Z238 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccne2Q9Z238 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccne2Q9Z238 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccne2Q9Z238 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccne2Q9Z238 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccne2Q9Z238 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccne2Q9Z238 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccne2Q9Z238 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccne2Q9Z238 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccne2Q9Z238 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccne2Q9Z238 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccne2Q9Z238 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccne2Q9Z238 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccne2Q9Z238 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Ccne2Q9Z238 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccne2Q9Z238 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccne2Q9Z238 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccne2Q9Z238 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccne2Q9Z238 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccne2Q9Z238 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccne2Q9Z238 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccne2Q9Z238 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms