Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1R4

D17h6s53e, Uncharacterized protein C6orf47 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D17h6s53eQ9Z1R4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
D17h6s53eQ9Z1R4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
D17h6s53eQ9Z1R4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
D17h6s53eQ9Z1R4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
D17h6s53eQ9Z1R4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
D17h6s53eQ9Z1R4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
D17h6s53eQ9Z1R4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
D17h6s53eQ9Z1R4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
D17h6s53eQ9Z1R4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
D17h6s53eQ9Z1R4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
D17h6s53eQ9Z1R4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
D17h6s53eQ9Z1R4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
D17h6s53eQ9Z1R4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
D17h6s53eQ9Z1R4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
D17h6s53eQ9Z1R4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
D17h6s53eQ9Z1R4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
D17h6s53eQ9Z1R4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
D17h6s53eQ9Z1R4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
D17h6s53eQ9Z1R4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
D17h6s53eQ9Z1R4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
D17h6s53eQ9Z1R4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
D17h6s53eQ9Z1R4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
D17h6s53eQ9Z1R4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
D17h6s53eQ9Z1R4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
D17h6s53eQ9Z1R4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
D17h6s53eQ9Z1R4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
D17h6s53eQ9Z1R4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
D17h6s53eQ9Z1R4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
D17h6s53eQ9Z1R4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
D17h6s53eQ9Z1R4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
D17h6s53eQ9Z1R4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
D17h6s53eQ9Z1R4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
D17h6s53eQ9Z1R4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
D17h6s53eQ9Z1R4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
D17h6s53eQ9Z1R4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
D17h6s53eQ9Z1R4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
D17h6s53eQ9Z1R4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
D17h6s53eQ9Z1R4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
D17h6s53eQ9Z1R4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
D17h6s53eQ9Z1R4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
D17h6s53eQ9Z1R4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
D17h6s53eQ9Z1R4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
D17h6s53eQ9Z1R4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
D17h6s53eQ9Z1R4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
D17h6s53eQ9Z1R4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
D17h6s53eQ9Z1R4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
D17h6s53eQ9Z1R4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
D17h6s53eQ9Z1R4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
D17h6s53eQ9Z1R4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
D17h6s53eQ9Z1R4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
D17h6s53eQ9Z1R4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
D17h6s53eQ9Z1R4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
D17h6s53eQ9Z1R4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
D17h6s53eQ9Z1R4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
D17h6s53eQ9Z1R4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
D17h6s53eQ9Z1R4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
D17h6s53eQ9Z1R4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
D17h6s53eQ9Z1R4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
D17h6s53eQ9Z1R4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
D17h6s53eQ9Z1R4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
D17h6s53eQ9Z1R4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
D17h6s53eQ9Z1R4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
D17h6s53eQ9Z1R4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
D17h6s53eQ9Z1R4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
D17h6s53eQ9Z1R4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
D17h6s53eQ9Z1R4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
D17h6s53eQ9Z1R4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
D17h6s53eQ9Z1R4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
D17h6s53eQ9Z1R4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
D17h6s53eQ9Z1R4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
D17h6s53eQ9Z1R4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
D17h6s53eQ9Z1R4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
D17h6s53eQ9Z1R4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
D17h6s53eQ9Z1R4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
D17h6s53eQ9Z1R4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
D17h6s53eQ9Z1R4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
D17h6s53eQ9Z1R4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
D17h6s53eQ9Z1R4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
D17h6s53eQ9Z1R4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
D17h6s53eQ9Z1R4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
D17h6s53eQ9Z1R4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
D17h6s53eQ9Z1R4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
D17h6s53eQ9Z1R4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
D17h6s53eQ9Z1R4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
D17h6s53eQ9Z1R4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
D17h6s53eQ9Z1R4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
D17h6s53eQ9Z1R4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
D17h6s53eQ9Z1R4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
D17h6s53eQ9Z1R4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
D17h6s53eQ9Z1R4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
D17h6s53eQ9Z1R4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
D17h6s53eQ9Z1R4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
D17h6s53eQ9Z1R4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
D17h6s53eQ9Z1R4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms