Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0U0

Xpr1, Xenotropic and polytropic retrovirus receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xpr1Q9Z0U0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Xpr1Q9Z0U0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Xpr1Q9Z0U0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Xpr1Q9Z0U0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Xpr1Q9Z0U0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Xpr1Q9Z0U0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Xpr1Q9Z0U0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Xpr1Q9Z0U0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Xpr1Q9Z0U0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Xpr1Q9Z0U0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Xpr1Q9Z0U0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Xpr1Q9Z0U0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Xpr1Q9Z0U0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Xpr1Q9Z0U0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Xpr1Q9Z0U0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Xpr1Q9Z0U0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Xpr1Q9Z0U0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Xpr1Q9Z0U0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Xpr1Q9Z0U0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Xpr1Q9Z0U0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Xpr1Q9Z0U0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Xpr1Q9Z0U0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Xpr1Q9Z0U0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Xpr1Q9Z0U0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Xpr1Q9Z0U0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Xpr1Q9Z0U0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Xpr1Q9Z0U0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Xpr1Q9Z0U0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Xpr1Q9Z0U0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Xpr1Q9Z0U0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Xpr1Q9Z0U0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Xpr1Q9Z0U0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Xpr1Q9Z0U0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Xpr1Q9Z0U0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Xpr1Q9Z0U0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Xpr1Q9Z0U0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Xpr1Q9Z0U0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Xpr1Q9Z0U0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Xpr1Q9Z0U0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Xpr1Q9Z0U0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Xpr1Q9Z0U0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Xpr1Q9Z0U0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Xpr1Q9Z0U0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Xpr1Q9Z0U0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Xpr1Q9Z0U0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Xpr1Q9Z0U0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Xpr1Q9Z0U0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Xpr1Q9Z0U0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Xpr1Q9Z0U0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Xpr1Q9Z0U0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Xpr1Q9Z0U0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Xpr1Q9Z0U0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Xpr1Q9Z0U0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Xpr1Q9Z0U0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Xpr1Q9Z0U0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Xpr1Q9Z0U0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Xpr1Q9Z0U0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Xpr1Q9Z0U0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Xpr1Q9Z0U0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Xpr1Q9Z0U0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Xpr1Q9Z0U0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Xpr1Q9Z0U0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Xpr1Q9Z0U0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Xpr1Q9Z0U0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Xpr1Q9Z0U0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Xpr1Q9Z0U0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Xpr1Q9Z0U0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Xpr1Q9Z0U0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Xpr1Q9Z0U0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Xpr1Q9Z0U0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Xpr1Q9Z0U0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Xpr1Q9Z0U0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Xpr1Q9Z0U0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Xpr1Q9Z0U0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Xpr1Q9Z0U0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Xpr1Q9Z0U0 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Xpr1Q9Z0U0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Xpr1Q9Z0U0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Xpr1Q9Z0U0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Xpr1Q9Z0U0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Xpr1Q9Z0U0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Xpr1Q9Z0U0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Xpr1Q9Z0U0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Xpr1Q9Z0U0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Xpr1Q9Z0U0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Xpr1Q9Z0U0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Xpr1Q9Z0U0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Xpr1Q9Z0U0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Xpr1Q9Z0U0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Xpr1Q9Z0U0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Xpr1Q9Z0U0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Xpr1Q9Z0U0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Xpr1Q9Z0U0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Xpr1Q9Z0U0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Xpr1Q9Z0U0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Xpr1Q9Z0U0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Xpr1Q9Z0U0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Xpr1Q9Z0U0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Xpr1Q9Z0U0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Xpr1Q9Z0U0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms