Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ7

Sh3bgr, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrQ9WUZ7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Sh3bgrQ9WUZ7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sh3bgrQ9WUZ7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sh3bgrQ9WUZ7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sh3bgrQ9WUZ7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sh3bgrQ9WUZ7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sh3bgrQ9WUZ7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sh3bgrQ9WUZ7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3bgrQ9WUZ7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh3bgrQ9WUZ7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh3bgrQ9WUZ7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh3bgrQ9WUZ7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms