Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnfsf13bQ9WU72 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnfsf13bQ9WU72 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnfsf13bQ9WU72 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnfsf13bQ9WU72 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnfsf13bQ9WU72 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnfsf13bQ9WU72 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnfsf13bQ9WU72 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnfsf13bQ9WU72 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnfsf13bQ9WU72 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnfsf13bQ9WU72 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnfsf13bQ9WU72 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnfsf13bQ9WU72 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnfsf13bQ9WU72 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnfsf13bQ9WU72 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnfsf13bQ9WU72 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnfsf13bQ9WU72 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnfsf13bQ9WU72 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnfsf13bQ9WU72 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnfsf13bQ9WU72 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnfsf13bQ9WU72 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnfsf13bQ9WU72 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnfsf13bQ9WU72 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnfsf13bQ9WU72 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnfsf13bQ9WU72 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnfsf13bQ9WU72 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnfsf13bQ9WU72 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnfsf13bQ9WU72 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnfsf13bQ9WU72 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnfsf13bQ9WU72 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnfsf13bQ9WU72 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnfsf13bQ9WU72 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnfsf13bQ9WU72 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnfsf13bQ9WU72 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnfsf13bQ9WU72 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnfsf13bQ9WU72 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnfsf13bQ9WU72 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnfsf13bQ9WU72 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnfsf13bQ9WU72 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnfsf13bQ9WU72 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnfsf13bQ9WU72 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnfsf13bQ9WU72 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnfsf13bQ9WU72 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnfsf13bQ9WU72 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tnfsf13bQ9WU72 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tnfsf13bQ9WU72 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnfsf13bQ9WU72 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnfsf13bQ9WU72 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnfsf13bQ9WU72 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnfsf13bQ9WU72 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnfsf13bQ9WU72 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnfsf13bQ9WU72 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnfsf13bQ9WU72 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnfsf13bQ9WU72 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnfsf13bQ9WU72 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnfsf13bQ9WU72 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnfsf13bQ9WU72 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnfsf13bQ9WU72 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnfsf13bQ9WU72 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnfsf13bQ9WU72 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnfsf13bQ9WU72 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnfsf13bQ9WU72 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnfsf13bQ9WU72 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnfsf13bQ9WU72 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnfsf13bQ9WU72 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnfsf13bQ9WU72 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnfsf13bQ9WU72 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnfsf13bQ9WU72 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnfsf13bQ9WU72 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnfsf13bQ9WU72 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnfsf13bQ9WU72 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnfsf13bQ9WU72 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnfsf13bQ9WU72 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnfsf13bQ9WU72 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnfsf13bQ9WU72 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnfsf13bQ9WU72 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnfsf13bQ9WU72 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnfsf13bQ9WU72 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnfsf13bQ9WU72 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnfsf13bQ9WU72 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnfsf13bQ9WU72 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnfsf13bQ9WU72 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnfsf13bQ9WU72 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnfsf13bQ9WU72 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnfsf13bQ9WU72 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnfsf13bQ9WU72 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnfsf13bQ9WU72 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnfsf13bQ9WU72 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnfsf13bQ9WU72 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnfsf13bQ9WU72 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnfsf13bQ9WU72 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnfsf13bQ9WU72 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnfsf13bQ9WU72 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnfsf13bQ9WU72 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnfsf13bQ9WU72 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnfsf13bQ9WU72 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnfsf13bQ9WU72 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnfsf13bQ9WU72 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnfsf13bQ9WU72 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnfsf13bQ9WU72 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms