Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scnn1bQ9WU38 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scnn1bQ9WU38 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scnn1bQ9WU38 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Scnn1bQ9WU38 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scnn1bQ9WU38 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scnn1bQ9WU38 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scnn1bQ9WU38 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scnn1bQ9WU38 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scnn1bQ9WU38 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scnn1bQ9WU38 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scnn1bQ9WU38 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scnn1bQ9WU38 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scnn1bQ9WU38 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scnn1bQ9WU38 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scnn1bQ9WU38 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scnn1bQ9WU38 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Scnn1bQ9WU38 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scnn1bQ9WU38 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Scnn1bQ9WU38 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scnn1bQ9WU38 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scnn1bQ9WU38 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scnn1bQ9WU38 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scnn1bQ9WU38 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scnn1bQ9WU38 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scnn1bQ9WU38 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Scnn1bQ9WU38 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scnn1bQ9WU38 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scnn1bQ9WU38 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scnn1bQ9WU38 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scnn1bQ9WU38 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scnn1bQ9WU38 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scnn1bQ9WU38 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scnn1bQ9WU38 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scnn1bQ9WU38 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scnn1bQ9WU38 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scnn1bQ9WU38 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scnn1bQ9WU38 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scnn1bQ9WU38 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scnn1bQ9WU38 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scnn1bQ9WU38 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scnn1bQ9WU38 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scnn1bQ9WU38 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scnn1bQ9WU38 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scnn1bQ9WU38 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scnn1bQ9WU38 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scnn1bQ9WU38 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scnn1bQ9WU38 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scnn1bQ9WU38 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scnn1bQ9WU38 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scnn1bQ9WU38 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scnn1bQ9WU38 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Scnn1bQ9WU38 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scnn1bQ9WU38 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Scnn1bQ9WU38 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scnn1bQ9WU38 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Scnn1bQ9WU38 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Scnn1bQ9WU38 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scnn1bQ9WU38 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scnn1bQ9WU38 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Scnn1bQ9WU38 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scnn1bQ9WU38 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Scnn1bQ9WU38 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scnn1bQ9WU38 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scnn1bQ9WU38 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scnn1bQ9WU38 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scnn1bQ9WU38 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scnn1bQ9WU38 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scnn1bQ9WU38 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scnn1bQ9WU38 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scnn1bQ9WU38 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scnn1bQ9WU38 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Scnn1bQ9WU38 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scnn1bQ9WU38 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scnn1bQ9WU38 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Scnn1bQ9WU38 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scnn1bQ9WU38 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Scnn1bQ9WU38 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scnn1bQ9WU38 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scnn1bQ9WU38 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scnn1bQ9WU38 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scnn1bQ9WU38 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scnn1bQ9WU38 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Scnn1bQ9WU38 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scnn1bQ9WU38 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scnn1bQ9WU38 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scnn1bQ9WU38 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scnn1bQ9WU38 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scnn1bQ9WU38 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scnn1bQ9WU38 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scnn1bQ9WU38 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scnn1bQ9WU38 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scnn1bQ9WU38 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scnn1bQ9WU38 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Scnn1bQ9WU38 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Scnn1bQ9WU38 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scnn1bQ9WU38 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scnn1bQ9WU38 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scnn1bQ9WU38 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scnn1bQ9WU38 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms