Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM3

Clcf1, Cardiotrophin-like cytokine factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcf1Q9QZM3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clcf1Q9QZM3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clcf1Q9QZM3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clcf1Q9QZM3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clcf1Q9QZM3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clcf1Q9QZM3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clcf1Q9QZM3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clcf1Q9QZM3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Clcf1Q9QZM3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clcf1Q9QZM3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clcf1Q9QZM3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clcf1Q9QZM3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clcf1Q9QZM3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clcf1Q9QZM3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clcf1Q9QZM3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clcf1Q9QZM3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clcf1Q9QZM3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clcf1Q9QZM3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clcf1Q9QZM3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clcf1Q9QZM3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Clcf1Q9QZM3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clcf1Q9QZM3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clcf1Q9QZM3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clcf1Q9QZM3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clcf1Q9QZM3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clcf1Q9QZM3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clcf1Q9QZM3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clcf1Q9QZM3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clcf1Q9QZM3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clcf1Q9QZM3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clcf1Q9QZM3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clcf1Q9QZM3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Clcf1Q9QZM3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clcf1Q9QZM3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clcf1Q9QZM3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clcf1Q9QZM3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clcf1Q9QZM3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clcf1Q9QZM3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clcf1Q9QZM3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clcf1Q9QZM3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Clcf1Q9QZM3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clcf1Q9QZM3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clcf1Q9QZM3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clcf1Q9QZM3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clcf1Q9QZM3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clcf1Q9QZM3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clcf1Q9QZM3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clcf1Q9QZM3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clcf1Q9QZM3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Clcf1Q9QZM3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clcf1Q9QZM3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clcf1Q9QZM3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clcf1Q9QZM3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clcf1Q9QZM3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clcf1Q9QZM3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clcf1Q9QZM3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clcf1Q9QZM3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Clcf1Q9QZM3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clcf1Q9QZM3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clcf1Q9QZM3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clcf1Q9QZM3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Clcf1Q9QZM3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clcf1Q9QZM3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clcf1Q9QZM3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clcf1Q9QZM3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clcf1Q9QZM3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clcf1Q9QZM3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clcf1Q9QZM3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clcf1Q9QZM3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clcf1Q9QZM3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Clcf1Q9QZM3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clcf1Q9QZM3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clcf1Q9QZM3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clcf1Q9QZM3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clcf1Q9QZM3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clcf1Q9QZM3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clcf1Q9QZM3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clcf1Q9QZM3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clcf1Q9QZM3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clcf1Q9QZM3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clcf1Q9QZM3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Clcf1Q9QZM3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clcf1Q9QZM3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clcf1Q9QZM3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clcf1Q9QZM3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clcf1Q9QZM3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clcf1Q9QZM3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clcf1Q9QZM3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clcf1Q9QZM3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clcf1Q9QZM3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clcf1Q9QZM3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clcf1Q9QZM3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clcf1Q9QZM3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clcf1Q9QZM3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clcf1Q9QZM3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clcf1Q9QZM3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clcf1Q9QZM3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clcf1Q9QZM3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clcf1Q9QZM3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clcf1Q9QZM3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms