Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ11

Exo1, Exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo1Q9QZ11 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Exo1Q9QZ11 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Exo1Q9QZ11 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Exo1Q9QZ11 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Exo1Q9QZ11 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Exo1Q9QZ11 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Exo1Q9QZ11 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Exo1Q9QZ11 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Exo1Q9QZ11 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Exo1Q9QZ11 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Exo1Q9QZ11 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Exo1Q9QZ11 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Exo1Q9QZ11 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Exo1Q9QZ11 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Exo1Q9QZ11 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Exo1Q9QZ11 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Exo1Q9QZ11 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Exo1Q9QZ11 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Exo1Q9QZ11 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Exo1Q9QZ11 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Exo1Q9QZ11 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Exo1Q9QZ11 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Exo1Q9QZ11 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Exo1Q9QZ11 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Exo1Q9QZ11 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Exo1Q9QZ11 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Exo1Q9QZ11 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Exo1Q9QZ11 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Exo1Q9QZ11 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Exo1Q9QZ11 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Exo1Q9QZ11 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Exo1Q9QZ11 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Exo1Q9QZ11 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Exo1Q9QZ11 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Exo1Q9QZ11 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Exo1Q9QZ11 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Exo1Q9QZ11 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Exo1Q9QZ11 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Exo1Q9QZ11 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Exo1Q9QZ11 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Exo1Q9QZ11 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Exo1Q9QZ11 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Exo1Q9QZ11 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Exo1Q9QZ11 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Exo1Q9QZ11 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Exo1Q9QZ11 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Exo1Q9QZ11 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Exo1Q9QZ11 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Exo1Q9QZ11 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Exo1Q9QZ11 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Exo1Q9QZ11 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Exo1Q9QZ11 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Exo1Q9QZ11 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Exo1Q9QZ11 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Exo1Q9QZ11 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Exo1Q9QZ11 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Exo1Q9QZ11 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Exo1Q9QZ11 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Exo1Q9QZ11 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Exo1Q9QZ11 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Exo1Q9QZ11 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Exo1Q9QZ11 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Exo1Q9QZ11 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Exo1Q9QZ11 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Exo1Q9QZ11 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Exo1Q9QZ11 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Exo1Q9QZ11 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Exo1Q9QZ11 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Exo1Q9QZ11 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Exo1Q9QZ11 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Exo1Q9QZ11 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Exo1Q9QZ11 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Exo1Q9QZ11 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Exo1Q9QZ11 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Exo1Q9QZ11 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Exo1Q9QZ11 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Exo1Q9QZ11 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Exo1Q9QZ11 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Exo1Q9QZ11 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Exo1Q9QZ11 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Exo1Q9QZ11 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Exo1Q9QZ11 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Exo1Q9QZ11 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Exo1Q9QZ11 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Exo1Q9QZ11 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Exo1Q9QZ11 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Exo1Q9QZ11 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Exo1Q9QZ11 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Exo1Q9QZ11 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Exo1Q9QZ11 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Exo1Q9QZ11 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Exo1Q9QZ11 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Exo1Q9QZ11 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Exo1Q9QZ11 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Exo1Q9QZ11 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Exo1Q9QZ11 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Exo1Q9QZ11 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Exo1Q9QZ11 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Exo1Q9QZ11 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Exo1Q9QZ11 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.3 ms