Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY30

Abcb11, Bile salt export pump, mousemouse

Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb11Q9QY30 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abcb11Q9QY30 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abcb11Q9QY30 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abcb11Q9QY30 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abcb11Q9QY30 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abcb11Q9QY30 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Abcb11Q9QY30 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Abcb11Q9QY30 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Abcb11Q9QY30 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Abcb11Q9QY30 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Abcb11Q9QY30 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Abcb11Q9QY30 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Abcb11Q9QY30 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Abcb11Q9QY30 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Abcb11Q9QY30 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Abcb11Q9QY30 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Abcb11Q9QY30 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Abcb11Q9QY30 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Abcb11Q9QY30 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Abcb11Q9QY30 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abcb11Q9QY30 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abcb11Q9QY30 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abcb11Q9QY30 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abcb11Q9QY30 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abcb11Q9QY30 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcb11Q9QY30 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcb11Q9QY30 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcb11Q9QY30 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcb11Q9QY30 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcb11Q9QY30 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcb11Q9QY30 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcb11Q9QY30 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcb11Q9QY30 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcb11Q9QY30 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcb11Q9QY30 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcb11Q9QY30 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcb11Q9QY30 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abcb11Q9QY30 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abcb11Q9QY30 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abcb11Q9QY30 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abcb11Q9QY30 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abcb11Q9QY30 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abcb11Q9QY30 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Abcb11Q9QY30 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abcb11Q9QY30 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abcb11Q9QY30 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abcb11Q9QY30 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abcb11Q9QY30 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcb11Q9QY30 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcb11Q9QY30 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcb11Q9QY30 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcb11Q9QY30 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcb11Q9QY30 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcb11Q9QY30 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcb11Q9QY30 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcb11Q9QY30 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcb11Q9QY30 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcb11Q9QY30 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcb11Q9QY30 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcb11Q9QY30 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcb11Q9QY30 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Abcb11Q9QY30 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Abcb11Q9QY30 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcb11Q9QY30 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcb11Q9QY30 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcb11Q9QY30 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcb11Q9QY30 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcb11Q9QY30 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcb11Q9QY30 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcb11Q9QY30 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcb11Q9QY30 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcb11Q9QY30 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcb11Q9QY30 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcb11Q9QY30 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcb11Q9QY30 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcb11Q9QY30 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcb11Q9QY30 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcb11Q9QY30 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Abcb11Q9QY30 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Abcb11Q9QY30 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcb11Q9QY30 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Abcb11Q9QY30 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcb11Q9QY30 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcb11Q9QY30 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcb11Q9QY30 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcb11Q9QY30 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcb11Q9QY30 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcb11Q9QY30 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcb11Q9QY30 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcb11Q9QY30 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcb11Q9QY30 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcb11Q9QY30 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcb11Q9QY30 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcb11Q9QY30 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcb11Q9QY30 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcb11Q9QY30 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcb11Q9QY30 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcb11Q9QY30 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcb11Q9QY30 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcb11Q9QY30 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms