Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim44Q9QXA7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim44Q9QXA7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim44Q9QXA7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim44Q9QXA7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim44Q9QXA7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim44Q9QXA7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim44Q9QXA7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim44Q9QXA7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim44Q9QXA7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim44Q9QXA7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim44Q9QXA7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim44Q9QXA7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim44Q9QXA7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim44Q9QXA7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim44Q9QXA7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim44Q9QXA7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim44Q9QXA7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim44Q9QXA7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim44Q9QXA7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim44Q9QXA7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim44Q9QXA7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim44Q9QXA7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim44Q9QXA7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trim44Q9QXA7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trim44Q9QXA7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trim44Q9QXA7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trim44Q9QXA7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim44Q9QXA7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim44Q9QXA7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim44Q9QXA7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim44Q9QXA7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim44Q9QXA7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim44Q9QXA7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim44Q9QXA7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim44Q9QXA7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim44Q9QXA7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim44Q9QXA7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim44Q9QXA7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim44Q9QXA7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim44Q9QXA7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim44Q9QXA7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim44Q9QXA7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim44Q9QXA7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim44Q9QXA7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim44Q9QXA7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim44Q9QXA7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim44Q9QXA7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim44Q9QXA7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim44Q9QXA7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim44Q9QXA7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim44Q9QXA7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim44Q9QXA7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim44Q9QXA7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim44Q9QXA7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim44Q9QXA7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim44Q9QXA7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim44Q9QXA7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim44Q9QXA7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim44Q9QXA7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim44Q9QXA7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim44Q9QXA7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim44Q9QXA7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim44Q9QXA7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim44Q9QXA7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim44Q9QXA7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim44Q9QXA7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim44Q9QXA7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim44Q9QXA7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim44Q9QXA7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim44Q9QXA7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim44Q9QXA7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim44Q9QXA7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim44Q9QXA7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim44Q9QXA7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim44Q9QXA7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim44Q9QXA7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim44Q9QXA7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim44Q9QXA7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim44Q9QXA7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim44Q9QXA7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim44Q9QXA7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim44Q9QXA7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim44Q9QXA7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim44Q9QXA7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim44Q9QXA7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim44Q9QXA7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim44Q9QXA7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim44Q9QXA7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim44Q9QXA7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim44Q9QXA7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim44Q9QXA7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim44Q9QXA7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim44Q9QXA7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim44Q9QXA7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim44Q9QXA7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim44Q9QXA7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim44Q9QXA7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim44Q9QXA7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Trim44Q9QXA7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms